儿童癫痫的临床全外显子测序：来自沙特阿拉伯的一家三级医疗中心的回顾性研究

《Journal of Applied Genetics》：Clinical whole exome sequencing in childhood epilepsy: a tertiary center retrospective study from Saudi Arabia

摘要

儿童癫痫，尤其是对药物具有抗性的癫痫，通常具有潜在的遗传病因。在近亲结婚率较高的群体中（如沙特阿拉伯），常 autosomal recessive disorders（常染色体隐性遗传病）的发病率较高。然而，在这种背景下，全外显子测序（WES）的诊断效果和临床实用性仍需进一步研究。我们在2017年5月至2021年11月期间对吉达费萨尔国王专科医院和研究中心（KFSHRC-J）进行了回顾性横断面研究。我们查阅了所有临床WES检测结果的患者病历（共561份），并纳入了108名14岁以下以癫痫为主要检测指征的儿科患者。从电子病历中提取了人口统计学数据、临床表现、影像学检查结果以及WES检测结果。根据ACMG指南对变异进行分类。在108名患者中（53名男性，占49%；55名女性，占51%），癫痫发病的平均年龄为2.6岁，77%（83/108）的患者有近亲结婚史。WES在98例患者（90.7%）中发现了可报告的基因变异，这些变异被归类为致病性/可能致病的变异（32例）或意义不明的变异（VUS，66例）。在剩余的10例患者（9.3%）中，未发现能够解释临床表型的足够变异。最终诊断率（即致病性或可能致病性变异能够解释临床表型的比率）为30%（32/108；95%置信区间：22–39%）。其中，72%（23/32）的确诊病例属于常染色体隐性遗传方式。如果将与临床表现密切相关的语义不明的变异也包括在内，潜在的诊断率可提高至60%（65/108）。WES检测结果直接影响了5%（5/108）患者的临床治疗，包括针对性代谢疗法、药物优化以及避免使用禁忌疗法。WES在儿童癫痫的诊断中显示出显著作用，尤其是在常染色体隐性遗传病高发的近亲结婚群体中。将WES整合到诊断工作流程中，有助于实施精准医疗，并支持早期遗传咨询。