PATZ1通过增强子处靶向核小体驱逐重塑染色质可及性促进中枢神经再生

《Communications Biology》：PATZ1 remodels the nucleosome landscape to promote chromatin accessibility in injured neurons

　　

摘要

成年中枢神经系统神经元在损伤后无法再生，部分原因在于维持生长抑制性染色质状态的表观遗传学限制。我们此前已表明，转录因子PATZ1可重新编程损伤皮质脊髓神经元的染色质可及性，并使再生相关基因位点进入启动状态，但其潜在机制尚不明确。在此，我们利用核小体分辨率分析揭示，PATZ1在再生相关基因位点诱导广泛的核小体驱逐。PATZ1过表达显著降低了核小体占有率和核小体定位模糊性，表明这是主动的染色质重组而非被动的去稳定化。这种重组优先发生在远端调控元件处，PATZ1在此驱动H3K27ac标记的活性增强子扩张超过3倍。这些位点的核小体驱逐可能有助于增强子激活，从而建立了染色质重组与转录重编程之间的机制联系。我们的发现表明，增强子处的靶向核小体驱逐是PATZ1介导的染色质重组的基础，为理解限制中枢神经系统再生基因表达的表观遗传屏障提供了机制洞察。