基于大规模蛋白质组学表征的早期乳头状甲状腺癌分子分型与预后标志物研究

《Nature Communications》：Large-scale proteomic characterization reveals clinically relevant subtypes of early-stage papillary thyroid cancer for prognostic prediction

摘要

乳头状甲状腺癌（PTC）发病率呈上升趋势。大多数患者确诊时处于早期阶段，尽管少数患者表现出侵袭性倾向。鉴于其通常具有惰性特征，关于早期 PTC 的管理仍存在争议，尤其是手术干预和长期监测策略。在此，我们基于 797 例患者的肿瘤样本，对早期 PTC 进行了大规模蛋白质组学表征。蛋白质组学图谱揭示了临床相关的模块，并鉴定出六个亚型，展现了从惰性到进展性疾病状态的不均一性谱系。值得注意的是，与较高进展风险相关的亚型显示出增强的核糖体发生和上皮间质转化特征。此外，结合机器学习与蛋白质共表达网络分析，我们鉴定出了 PTC 进展风险的预测标志物，如 GPX3 和 TMSB4X。临床数据和蛋白质组学数据的整合为更深入理解早期 PTC 生物学提供了宝贵资源，并为患有惰性或进展性疾病的患者制定个性化管理策略提供了指导。