巴西城市水库中Dicistroviridae科相关RNA病毒的宏基因组鉴定与系统发育分析

《Microorganisms》：Molecular Characterization of Previous Unclassified Dicistroviruses in Water Reservoir in S?o Paulo, Brazil

　　

摘要

本研究采用病毒宏基因组学方法，鉴定了与Dicistroviridae科相关的病毒，样本采集自巴西圣保罗州城市水库的淡水样品。通过下一代测序技术，检测到5个完整的RNA基因组，这些基因组与Dicistroviridae科具有相似性。这些基因组的长度从8032到9425个核苷酸不等，每个基因组包含两个具有保守蛋白质结构域和Dicistroviridae科特征性内部核糖体进入位点（IRES）的开放阅读框（ORF）。基于非结构性（ORF1）和结构性（ORF2）多聚蛋白的氨基酸序列进行的系统发育和遗传同一性分析表明，这5个基因组代表4个推定的新物种，暂时命名为Hydro virus 1至Hydro virus 4。这些发现加深了我们对Dicistroviridae科在水生环境中多样性和分布的认识。