澳大利亚维多利亚州猪群中隐孢子虫属和贾第鞭毛虫的分子流行病学特征及基因型多样性分析

《Parasites & Vectors》：First molecular survey of pigs in Victoria, Australia, reveals widespread Cryptosporidium infection, limited Giardia duodenalis occurrence and genotypes with zoonotic potential

　　

摘要

背景

Cryptosporidium属和Giardia duodenalis是具有兽医和公共卫生意义的肠道原生动物寄生虫，然而澳大利亚猪群相关的分子流行病学数据仍然有限，且在维多利亚州尚未开展过相关研究。本研究估计了澳大利亚维多利亚州各农场猪粪便样本中Cryptosporidium属和G. duodenalis的流行率，并对其物种组成和基因型多样性进行了调查。

方法

共从澳大利亚维多利亚州37个农场的不同年龄段的猪身上收集了626份粪便样本。通过针对核糖体rRNA基因小亚基（SSU）和Cryptosporidium的gp60保守序列位点以及G. duodenalis的tpi位点的嵌套PCR技术进行分子检测和鉴定，随后进行Sanger测序。

结果

在28个农场的320份样本（占51.1%）中检测到了Cryptosporidium属寄生虫，其中C. scrofarum（77.5%）和C. suis（18.4%）占主导地位。在一个农场的三份猪粪便样本中检测到了C. ubiquitum的DNA。亚型检测发现C. suis的XXVa-1亚型和C. ubiquitum的XIIa亚型，这两种亚型此前也在人类中曾被发现。Giardia duodenalis在三个农场的7份样本（占1.1%）中被检测到，鉴定了E组合（n=5）和A组合（n=2）。Cryptosporidium的流行率在不同年龄组和养殖系统中存在显著差异，在断奶猪（68.6%）和半集约化养殖系统（78.2%）中最高，而在成年猪中未检测到。

结论

这些研究结果为维多利亚州猪群中Cryptosporidium属和G. duodenalis的分子谱提供了初步数据，表明这两种寄生虫在养猪系统中广泛存在，识别出了具有动物源性传播潜力的基因型，并强调了在澳大利亚养猪业中持续监测和针对性寄生虫管理的必要性。

图形摘要

背景

Cryptosporidium属和Giardia duodenalis是具有兽医和公共卫生意义的肠道原生动物寄生虫，然而澳大利亚猪群相关的分子流行病学数据仍然有限，且在维多利亚州尚未开展过相关研究。本研究估计了澳大利亚维多利亚州各农场猪粪便样本中Cryptosporidium属和G. duodenalis的流行率，并对其物种组成和基因型多样性进行了调查。

方法

共从澳大利亚维多利亚州37个农场的不同年龄段的猪身上收集了626份粪便样本。通过针对核糖体rRNA基因小亚基（SSU）和Cryptosporidium的gp60保守序列位点以及G. duodenalis的tpi位点的嵌套PCR技术进行分子检测和鉴定，随后进行Sanger测序。

结果

在28个农场的320份样本（占51.1%）中检测到了Cryptosporidium属寄生虫，其中C. scrofarum（77.5%）和C. suis（18.4%）占主导地位。在一个农场的三份猪粪便样本中检测到了C. ubiquitum的DNA。亚型检测发现C. suis的XXVa-1亚型和C. ubiquitum的XIIa亚型，这两种亚型此前也在人类中曾被发现。Giardia duodenalis在三个农场的7份样本（占1.1%）中被检测到，鉴定了E组合（n=5）和A组合（n=2）。Cryptosporidium的流行率在不同年龄组和养殖系统中存在显著差异，在断奶猪（68.6%）和半集约化养殖系统（78.2%）中最高，而在成年猪中未检测到。

结论

这些研究结果为维多利亚州猪群中Cryptosporidium属和G. duodenalis的分子谱提供了初步数据，表明这两种寄生虫在养猪系统中广泛存在，识别出了具有动物源性传播潜力的基因型，并强调了在澳大利亚养猪业中持续监测和针对性寄生虫管理的必要性。

图形摘要