《Advanced Science》:The Characteristics of Tumor Microenvironment by the Single Cell Profile in Endometrial Cancer of no Specific Molecular Profile (NSMP) Subtype
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无特定分子特征(no specific molecular profile, NSMP)亚型子宫内膜癌(endometrial cancer, EC)缺乏特异性分子特征,NSMP EC中肿瘤微环境(tumor microenvironment, TME)与复发
无特定分子特征(no specific molecular profile, NSMP)亚型子宫内膜癌(endometrial cancer, EC)缺乏特异性分子特征,NSMP EC中肿瘤微环境(tumor microenvironment, TME)与复发的关系仍未完全阐明。本研究整合单核RNA测序(single-nucleus RNA sequencing, snRNA-seq)、空间转录组学(spatial transcriptomics, ST)和多重免疫组织化学(multiplex immunohistochemistry, mIHC),以阐明NSMP EC的TME及复发机制。结果显示,NSMP EC中免疫浸润减少、免疫抑制细胞增多,包括SPP1+巨噬细胞和调节性T细胞(regulatory T cells, Tregs)。在复发前收集的原发NSMP EC肿瘤中,观察到更多具有高干性评分的上皮细胞簇。在NSMP EC中,尖端内皮细胞和MMP11+ LEF1+癌相关成纤维细胞(cancer-associated fibroblasts, CAFs)与血管生成和上皮-间充质转化相关,CD4+ T细胞处于应激反应状态且功能受损。有趣的是,研究人员发现了一类以SPP1表达为特征的肿瘤相关巨噬细胞(tumor-associated macrophages, TAMs)亚群,其可能通过SPP1-CD44潜在促进CD4+ T细胞应激并维持上皮细胞干性,从而重塑TME,并可能促进肿瘤细胞增殖和迁移,该作用已通过体外实验验证。本研究推进了对复发相关TME的机制理解,并为NSMP EC患者个性化治疗的发展提供了基础。
论文解读
子宫内膜癌(endometrial cancer, EC)是常见妇科恶性肿瘤,2026年美国预计新发62 870例、死亡14 450例;约7%—15%早期和40%—70%晚期患者复发,5年生存率20%—25%。EC分子分型包括POLEmut、MSI-H/MMRd、无特定分子特征(no specific molecular profile, NSMP)和p53abn;NSMP约占原发EC的50%,缺乏特异性分子特征,难以精准治疗。肿瘤微环境(tumor microenvironment, TME)由免疫细胞、间充质细胞、炎症介质、内皮细胞和细胞外基质组成,与治疗反应相关。NSMP呈免疫沙漠表型,CD8
+ T细胞和NK细胞浸润少、免疫检查点低表达,缺乏有效抗肿瘤免疫;既往NSMP研究多关注临床病理和基因组特征,TME与复发关系仍未完全阐明。为此,研究人员整合单核RNA测序(single-nucleus RNA sequencing, snRNA-seq)、空间转录组学(spatial transcriptomics, ST)和多重免疫组织化学(multiplex immunohistochemistry, mIHC),系统比较复发(R)与无复发(NR)NSMP EC原发肿瘤的TME差异,论文发表于《Advanced Science》。该研究推进了对复发相关TME的机制理解,并为NSMP EC个体化治疗提供基础。
关键技术方法:样本来自2020—2023年Fudan University Shanghai Cancer Center(FUSCC)的NSMP EC原发肿瘤队列,snRNA-seq 10例(6 NR、4 R),ST 2例,mIHC 6例(3 NR、3 R)。研究人员联合CellChat、inferCNV、NMF、Monocle2、CytoTRACE、AUCell/UCell/GSVA、decoupleR、scMetabolism及TCGA-UCEC生存分析;体外以SPP1敲低/过表达巨噬细胞与Jurkat、Ishikawa细胞共培养,采用Western blot、RT-qPCR和成球实验验证。
研究结果:
2.1 NSMP EC细胞群体图谱(Cell Population Landscapes of NSMP EC):snRNA-seq鉴定上皮细胞、内皮细胞、成纤维细胞和免疫细胞,免疫细胞比例最低,R肿瘤中成纤维细胞和内皮细胞相对较多;ST将组织分为上皮丰富、内皮丰富、基质丰富和免疫丰富区域。
2.2 R肿瘤上皮细胞干性评分更高(Epithelial Cells of R Tumors Showed Higher Stemness Signature Score):inferCNV识别恶性上皮细胞并分8簇,R以Epi_C2/Epi_C3为主、NR以Epi_C0为主;R肿瘤上皮细胞干性评分较高,Epi_C2干性最高并与TCGA-UCEC中EC患者较差总生存期(overall survival, OS)相关;R中JAK-STAT和p53通路激活,CD44高表达且空间定位于R肿瘤区域。
2.3 MMP11
+ LEF1
+ CAFs促进R肿瘤血管生成和肿瘤细胞生长(MMP11
+ LEF1
+ CAFs Promoted Angiogenesis and Tumor Cell Growth in R Tumors):内皮细胞分5簇,tip内皮细胞与血管生成和上皮-间充质转化(epithelial-mesenchymal transition, EMT)相关且血管生成评分最高;成纤维细胞分4簇,MMP11
+ LEF1
+癌相关成纤维细胞(cancer-associated fibroblasts, CAFs)可能参与EMT、TGF-β、WNT_β-catenin和血管生成,空间上MMP11与LEF1共定位在R肿瘤区域。
2.4 NSMP EC中CD4
+ T细胞处于应激反应状态(CD4
+ T Cells Were in a Stress Response State in NSMP EC):CD4
+ T细胞分Tn、Tpro、Treg、Tm和应激反应T细胞(stress response T cells, TSTR);所有CD4
+ T细胞应激评分高,调节性T细胞(regulatory T cells, Tregs)激活和抑制评分最高;HSPA1A/HSPA1B在TSTR高表达并与CD4空间共定位。
2.5 CHI3L1
+ TAMs与EC较差OS相关(CHI3L1
+ TAMs Were Associated With Worse OS in Endometrial Cancer):巨噬细胞分6簇,R中MRC1
+、SPP1
+、CHI3L1
+肿瘤相关巨噬细胞(tumor-associated macrophages, TAMs)增多,M2样评分高于M1样;TCGA-UCEC中CHI3L1
+ TAMs多者OS短,CD163与CHI3L1共定位在R肿瘤更强。
2.6 细胞间通讯揭示高表达SPP1巨噬细胞在TME中的关键作用(Intercellular Communication Revealed the Pivotal Role of Macrophages Highly Expressing SPP1 in TME):CellChat显示R肿瘤13种受体-配体信号富集,SPP1为最显著输出信号;SPP1-CD44轴主要作用于成纤维细胞、T细胞、DC、巨噬细胞和上皮细胞;SPP1
+ TAMs与Epi_C2和CD4_TSTR互作;mIHC验证SPP1
+CD68
+ TAMs与CD44
+CD4
+ T细胞及CD44
+上皮细胞在R中距离更短、共定位更高。
2.7 SPP1
+巨噬细胞促进T细胞应激并维持上皮细胞干性(SPP1
+ Macrophages Promote T Cell Stress and Maintain Epithelial Cell Stemness):体外敲低/过表达SPP1巨噬细胞共培养显示,SPP1敲低降低Jurkat细胞HSP70、LAG3、PD-1及HSPA1A/HSPA1B,过表达增加而抗CD44逆转;SPP1过表达巨噬细胞维持Ishikawa细胞CD44、CD133和成球能力。
讨论部分总结:讨论指出NSMP EC免疫细胞缺乏而免疫抑制细胞增加,R肿瘤具有更多干性上皮细胞和增强的细胞间通讯;Epi_C2高干性且与较差预后相关,tip内皮细胞及MMP11
+ LEF1
+ CAFs与血管生成、EMT等通路相关;CD4
+ T细胞高应激评分提示功能受损,TSTR可能与免疫检查点抑制剂(immune checkpoint inhibitors, ICIs)不良反应相关;CHI3L1
+ TAMs与不良预后相关,SPP1
+和MRC1
+ TAMs可能促进免疫抑制TME。局限性包括单中心回顾性研究、snRNA-seq/ST/mIHC样本量有限及NSMP异质性,需更大队列和体内功能实验验证,并需阐明SPP1-CD44、MDK-LRP1和ANGPT2-TEK轴。研究结论翻译:总之,该研究为NSMP EC的TME特征及细胞间相互作用提供了新视角,并为NSMP EC患者的治疗提供了潜在靶点。