基于游离DNA测序的扩展型无创产前检测用于染色体和单基因疾病：与羊膜穿刺术的盲法比较

《Prenatal Diagnosis》：Extended Non-Invasive Prenatal Testing for Chromosomal and Monogenic Disorders by Cell-Free DNA Sequencing: A Blinded Comparison With Amniocentesis

【字体：大中小】 时间：2026年10月22日 来源：Prenatal Diagnosis 3.1

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　　摘要目的评估分子整合非侵入性胎儿外显子组测序(iNIFS)——即利用母体血浆游离DNA进行临床外显子组测序——能否与配对的羊膜穿刺术按孕次保持一致。方法对641例连续妊娠进行前瞻性、盲法、单中心、配对样本诊断准确性研究。这些妊娠在第16至18周因临床指征接

摘要

目的

评估分子整合非侵入性胎儿外显子组测序(iNIFS)——即利用母体血浆游离DNA进行临床外显子组测序——能否与配对的羊膜穿刺术按孕次保持一致。

方法

对641例连续妊娠进行前瞻性、盲法、单中心、配对样本诊断准确性研究。这些妊娠在第16至18周因临床指征接受羊膜穿刺。血浆游离DNA经低深度全基因组测序筛查非整倍体和拷贝数变异(CNV)，并在短片段富集后进行父-母-胎儿三联设计的临床外显子组测序。参考标准包括QF-PCR、核型分析、阵列比较基因组杂交(aCGH)以及必要时对羊水DNA进行的三联临床外显子组测序。

结果

在641例妊娠中，iNIFS可在624例(97.3%)获得可报告结果；612例(95.5%)具有完整配对数据，构成分析人群。参考标准在612例中的107例(17.5%)中确认了致病性或可能致病性发现。NIPT检出106例真阳性、503例真阴性、2例不一致阳性和1例不一致阴性：敏感性为99.1%(95% CI 94.9–99.8)，特异性为99.6%(98.6–99.9)，阳性预测值为98.1%(93.5–99.5)，阴性预测值为99.8%(98.9–100.0)，一致率为99.5%，Cohen's κ为0.98。不一致的阴性结果为一例母体遗传的变异，而母体与胎儿贡献的区分在此类别中最为困难。

结论

分子iNIFS在染色体异常、拷贝数变异及单基因病方面与配对羊膜穿刺术显示出高度一致性，同时保留了明确的无法判断率。多中心验证及对阳性结果进行侵入性确认仍然必要。

关键点

关于该主题目前已知的内容？
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  游离DNA筛查已用于常见非整倍体，但其报告的是风险而非诊断，阳性结果仍需侵入性确认。
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  将其扩展至单基因病和致病性CNV仍基于有限数据，且缺乏配对的侵入性对照比较。
本研究有何补充？
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  在612例具有配对羊膜穿刺的妊娠中，分子iNIFS检出了107例致病性发现中的106例，并出现2例不一致阳性。
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  对染色体异常和拷贝数变异的检测是完整的；唯一漏检的案例为母体遗传的变异。