基于 PANDORA-seq 技术解析术后认知功能障碍小鼠海马区修饰小非编码 RNA 特征

《Scientific Data》：Small non-coding RNA profiling in the hippocampus of mice with postoperative cognitive dysfunction

　　

摘要

术后认知功能障碍（POCD）常见于老年手术患者，其与记忆、注意力和执行功能的障碍相关，这些障碍会显著降低患者的生活质量。POCD的确切发病机制仍不清楚，尽管有证据表明创伤可能引发表观遗传变化。传统的测序方法受到RNA修饰导致的逆转录中断的影响，这可能会导致具有重要调控功能的小非编码RNA（sncRNAs）的缺失或代表性不足。在此研究中，我们采用了PANDORA-seq技术（一种能够克服RNA修饰导致的测序中断的全景RNA显示方法），对术后认知损伤小鼠海马区中高度修饰的sncRNAs进行了全面分析。该数据集描绘了对照组和手术处理小鼠在术后早期阶段海马区sncRNA的种类组成，包括miRNAs、tsRNAs、rsRNAs和piRNAs。我们进行了测序质量控制分析，并通过qRT-PCR定量检测了部分tsRNAs。此外，还对这些tsRNAs与其对应的tRNAs进行了结构比对。总体而言，这一资源为研究术后早期认知功能障碍相关的神经表观遗传变化提供了基础，并有助于构建关于POCD分子机制的假设。