简单总结
Burkitt淋巴瘤是一种生长迅速的血液癌症，其发病机制与MYC基因的异常激活密切相关。小鼠模型被广泛用于研究该疾病的发病过程，但需要验证这些模型与人类疾病的相似性。在本研究中，我们比较了人类EBV阴性Burkitt淋巴瘤与由MYC基因及磷脂酰肌醇3-激酶（PI3K）激活驱动的小鼠模型在DNA甲基化方面的差异（DNA甲基化是调节基因活性的重要因素）。我们发现两种模型在涉及细胞信号传导和B细胞生物学的基因调控区域具有相似的甲基化模式。这些结果表明，该小鼠模型能够再现人类Burkitt淋巴瘤的重要表观遗传特征，并有助于探索该疾病的共同发病机制。
摘要
背景/目的： Burkitt淋巴瘤（BL）是一种具有侵袭性的生发中心B细胞（gcBC）恶性肿瘤，其发病机制与MYC基因的失调及相关的分子改变有关。结合了gcBC中持续激活的MYC和PI3K活性的人鼠模型能够很好地模拟人类BL的关键特征，但该模型与人类疾病的表观遗传相似性尚未得到详细研究。本研究比较了人类散发型EBV阴性BL与该小鼠模型在全基因组范围内的DNA甲基化模式。 方法：使用Illumina测序技术，比较了37个人类BL样本和20个gcBC对照样本以及8个由MYC/PI3K驱动的小鼠肿瘤样本和11个小鼠gcBC对照样本的DNA甲基化谱型。通过线性建模识别差异甲基化的CpG位点，并进行了染色质状态分析、跨物种基因重叠分析、蛋白质相互作用分析及通路富集分析。 结果：两种模型均表现出整体DNA甲基化水平降低的现象，且gcBC的甲基化模式具有明显差异。在BL中甲基化水平降低的CpG位点主要位于基因增强子区域，而在潜在启动子区域的CpG位点则表现出甲基化水平升高。研究发现，人类和小鼠BL共有695个高度甲基化的基因和512个低甲基化的基因。进一步将分析范围限定在基因调控区域后，确定了86个在两种模型中均一致低甲基化的基因。这些基因主要参与细胞内信号传导和鞘脂信号传导的调控过程，包括GNA13、RASA3、RASAL1、SPRED2、PIK3R2、PRKCA、PRKCE和FYN等GTP酶和激酶信号通路的调控因子。此外，该保守基因集还包括在生发中心B细胞生物学中起关键作用的基因，如FOXO1、BACH2和NR3C1。 结论：人类和小鼠BL在DNA甲基化调控方面存在共同特征，这支持了将MYC/PI3K小鼠模型作为研究BL表观遗传机制的有效工具。
