《Food Research International》：What data curation reveals about epidemiological trends and data quality in 24?years of foodborne disease outbreaks in Brazil
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研究人员对巴西24年间的食源性疾病暴发（foodborne disease outbreaks）数据进行了系统化数据整理（data curation）。经整理后，超过43.59%的暴发记录需要修正。大多数暴发记录缺少病原学因子（etiological agen
研究人员对巴西24年间的食源性疾病暴发（foodborne disease outbreaks）数据进行了系统化数据整理（data curation）。经整理后，超过43.59%的暴发记录需要修正。大多数暴发记录缺少病原学因子（etiological agent）和涉及食品（implicated food）的信息。指示菌（indicator bacteria）频繁被错误报告为致病因子。数据整理还揭示了与致命性暴发相关的未充分报告的病原体（underreported pathogens）。
论文解读
**研究背景与问题**
食源性疾病（foodborne diseases）是全球重大公共卫生挑战，估计每年影响6亿人并导致约42万人死亡。尽管实施了危害分析与关键控制点（HACCP）等食品安全管理体系，食源性疾病暴发仍频繁发生，常与不当食品处理、卫生条件差和控制措施失效有关。巴西的食源性和水源性疾病暴发监测（VE-DTHA）依托国家疾病强制报告信息系统（Sinan）、急性腹泻病哨点监测系统（Sivep-DDA）以及公共卫生实验室（Lacen）等构成的多学科网络运行。然而，官方暴发数据存在大量缺失、实验室确认不足、录入不一致等局限，甚至出现将指示微生物误报为致病原的情况。为准确评估疾病负担并支持循证公共卫生决策，有必要在流行病学分析前系统评价数据的完整性和一致性。该研究旨在评价巴西2000—2023年食源性疾病暴发数据的完整性与一致性，并利用可用信息分析其流行病学模式，识别监测系统关键缺口。
**研究方法**
数据来源为巴西卫生部2026年1月公开的官方数据集“Banco de dados simplificado de surto de DTHA (2000 a 2023)”，包含2000—2006年与2007—2023年两个分表。研究人员合并后进行了数据清洗、拼写纠正、市名和病原体名称标准化，并按巴西地理与统计研究所（IBGE）官方市代码进行空间聚合；排除了化学/毒性因子或人传人传播记录，删除重复记录。病原体按属、种或致病变型标准化并分类；需氧嗜中温菌、总大肠菌群、耐热大肠菌群、通用大肠杆菌（Escherichia coli）及肠杆菌科等被视为指示微生物。采用Pearson卡方检验、两比例卡方检验和Holm法多重比较校正进行区域间比较，显著性水平为0.05。
**研究结果**
**研究数据集**
经数据库合并、排除和去重，最终纳入2000—2023年巴西16,097起食源性疾病暴发。共排除65起化学/毒性因子或人传人传播记录，345起缺乏关键信息的记录，以及332条重复记录。
**时间分布与结局**
年度暴发数在286起（2020年）至1106起（2023年）之间波动，2011—2014年呈现持续较高报告频率。死亡数介于2例（2003年）至31例（2023年），死亡高峰出现在2004年、2008年、2015年和2023年。暴发数较高的年份并不一定对应更高的死亡数。
**最大规模暴发及致死事件**
病例数最大的暴发主要集中在东南部地区，尤其以圣保罗州为主；轮状病毒和诺如病毒等肠道病毒是大型暴发中最常检出的病原，水源常为传播载体。死亡人数最高的暴发出现在里约热内卢（2004年，15例死亡，病原为Enterobacter hormaechei）和科阿里（2008年，13例死亡，病原为Salmonella spp.），且多与医院、长期照护机构等集体环境相关。
**空间分布**
巴西全国年均报告率为每百万居民3.5起，南部最高（6.8），东北部最低（2.4）。24年间仅2378个市（42.7%）报告至少一起暴发，空间分布高度不均；圣保罗市（1225起）和里约热内卢市（1016起）的记录数最高，其次是累西腓（616起）。
**病原学因子**
全国60.25%的暴发病原未知，细菌占31.35%，病毒占4.16%，寄生虫占0.87%。在已鉴定的细菌中，Salmonella spp.报告最多（1750起），其次为葡萄球菌（984起）、Bacillus cereus（416起）和Clostridium perfringens（218起）；多种致泻性大肠杆菌亦有报告。轮状病毒是最常见的病毒病原，Trypanosoma cruzi是最常见寄生虫。死亡记录中，病原未知或不确定者占多数；已鉴定病原中Salmonella spp.致死数最高，其后为轮状病毒、Enterobacter hormaechei和甲型肝炎病毒。部分死亡暴发将通用大肠杆菌列为指示微生物，研究人员强调不应据此推断其直接致病因。
**食品媒介、暴发场所与确认标准**
53.56%的暴发未报告涉及食品。在已知食品媒介中，混合食品和水最常见，动物源食品（牛肉、禽肉）和蛋制品也较常报告；南部地区蛋制品相关暴发频率更高。家庭是最主要发生场所，其次为餐馆；学校、日托机构和集体单位也占相当比例。暴发确认标准以临床—流行病学标准最多（4855起），实验室确认所占比例较小。
**数据质量与完整性**
43.59%的暴发记录需要修正；南部修正率最高（47.31%），东北部最低（39.71%）。最常见修正原因是确认标准缺失或未知（25.38%）以及暴露人数、病例数或死亡数缺失（24.07%），其次是指示微生物被报告为病原体（7.83%）和重复记录（1.32%）。病原学因子未知在中西部和北部比例较高，涉及食品未知在东南部和北部比例较高。此外，788起暴发（4.90%）存在病例数超过暴露人数的内部逻辑不一致。
**讨论总结**
研究人员认为，巴西暴发数据中高比例缺失和低病原鉴定率不仅是数据录入问题，也反映监测链条中多个环节的断裂，包括患者就医行为不足、临床诊断能力有限、样本采集不及时、实验室检测范围受限以及食品溯源困难等。官方报告的暴发可能只是真实疾病负担的“冰山一角”。区域差异与基础设施、实验室能力、人员培训和系统整合程度有关；南部和东南部虽然社会经济发展指标较好，但报告量大，因而暴露更多需要修正的记录。通过数据整理，既往官方报告较少出现的病原，如单核细胞增生李斯特菌（Listeria monocytogenes）、弯曲菌属（Campylobacter spp.）和产志贺毒素大肠杆菌（STEC），显示出与重症和死亡相关的记录，提示其“缺席”可能源于检出、报告和数据处理限制。改进方向包括加强基层专业人员培训、扩大实验室检测组合、推进流行病学与实验室信息系统整合、建立实时或近实时数字报告平台，并利用移动应用、人工智能和远程医疗等工具提升监测敏感性和数据可用性；巴西统一卫生系统（SUS）的分布式网络为上述改进提供了基础平台。
**研究结论**
巴西食源性疾病暴发监测的主要限制在于数据质量和完整性。大量缺失信息、记录不一致和病原鉴定不足限制了对暴发动态的准确认识，也削弱了公共卫生决策的基础。未知病原占主导以及全球重要病原体检出率低，说明当前监测系统仅捕获食源性疾病真实负担的一小部分。因此，提高数据质量、扩大诊断能力是加强监测和制定有效预防控制策略的关键；SUS广泛且分散的基础设施有潜力成为整合各行政层级数据、推动全国食品安全实现数据驱动管理的平台。
