南极西部毛德皇后地(WDML)冰原岛峰可培养微生物多样性及其环境适应策略研究

《Frontiers in Microbiology》:Microbial diversity and adaptation Strategies in the nunataks of Western Dronning Maud Land, Antarctica

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年10月22日 来源:Frontiers in Microbiology 5.8

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  南极土壤生态系统蕴含着独特的微生物群落,它们能够在长期低温、高强度紫外线辐射、干燥、寡营养条件等多种环境胁迫下生存。本研究旨在表征栖息于南极西部毛德皇后地(Western Dronning Maud Land, WDML)Jutulsessen和Ahlmann

  
南极土壤生态系统蕴含着独特的微生物群落,它们能够在长期低温、高强度紫外线辐射、干燥、寡营养条件等多种环境胁迫下生存。本研究旨在表征栖息于南极西部毛德皇后地(Western Dronning Maud Land, WDML)Jutulsessen和Ahlmannryggen山脉独特内陆冰原岛峰中的可培养微生物群落,并探索其潜在的环境适应策略。研究人员使用不同的生长培养基从土壤样品中分离得到代表不同菌落形态型的细菌和真菌分离株。细菌分离株通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)结合MALDI BioTyper、16S rRNA基因测序及脂肪酸甲酯(FAME)分析进行了鉴定和表征。在经MALDI-TOF MS分析的96株细菌分离株中,75株产生了优质谱图,其中13株鉴定至种水平;其余62株产生的优质谱图对目前有限的南极细菌MALDI-TOF MS参考数据库构成了重要补充。16S rRNA测序鉴定出37种细菌,隶属于多个生态多样化属,即不动杆菌属(Acinetobacter)、节杆菌属(Arthrobacter)、芽孢杆菌属(Bacillus)、短波单胞菌属(Brevundimonas)、短状杆菌属(Brachybacterium)、短小杆菌属(Curtobacterium)、皮球菌属(Dermacoccus)、迪茨氏菌属(Dietzia)、两面神菌属(Janibacter)、耐冷菌属(Knoellia)、考克氏菌属(Kocuria)、皮肤球菌属(Kytococcus)、赖氨酸芽孢杆菌属(Lysinibacillus)、微杆菌属(Microbacterium)、微球菌属(Micrococcus)、甲基杆菌属(Methylobacterium)、莫拉菌属(Moraxella)、副球菌属(Paracoccus)、Pontibacter属、假单胞菌属(Pseudomonas)、假节杆菌属(Pseudarthrobacter)、红球菌属(Rhodococcus)、罗氏菌属(Rothia)、鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)、寡养单胞菌属(Stenotrophomonas)和葡萄球菌属(Staphylococcus)。这一细菌组合不仅具有分类学多样性,而且包含与寒冷和极端环境具有既有生态联系的类群。内转录间隔区(ITS)测序表明存在四个真菌属,即Gelatinofungus、Leuconeurospora、假裸囊菌属(Pseudogymnoascus)和弯颈霉属(Tolypocladium),它们对极地环境具有生态亲和力。FAME分析揭示了支链和单不饱和脂肪酸占主导地位,这些脂肪酸有助于维持细胞膜流动性,作为对严酷南极环境的适应策略。总之,研究结果表明,西部毛德皇后地的冰原岛峰土壤蕴藏着与寒冷和极端环境密切相关的多样化可培养微生物组合,同时其脂肪酸特征与南极条件下的生理适应相一致。据研究人员所知,本研究首次对栖息于南极西部毛德皇后地Jutulsessen和Ahlmannryggen山脉冰原岛峰的可培养微生物群落进行了全面描述。
论文解读:南极西部毛德皇后地冰原岛峰的可培养微生物多样性与适应策略

研究背景与科学问题:南极土壤微生物群落能够在长期低温、强紫外辐射、干燥和寡营养等极端条件中生存。然而,南极陆地表面仅约2%的区域在夏季无冰,这些无冰区尤其是内陆冰原岛峰是高度隔离且空间异质的生境。以往研究多采用免培养技术并集中于南极半岛及大陆可达区域,而对西部毛德皇后地(WDML)内陆冰原岛峰的可培养微生物知之甚少。培养组学(culturomics)方法能直接获取菌株并评估其生理特性,对理解极端环境适应机制和发掘生物技术资源至关重要。为此,研究人员对WDML中Jutulsessen和Ahlmannryggen山脉九个地理隔离的冰原岛峰以及一个企鹅聚居地土壤开展了可培养微生物学研究。

研究内容与总体结论:研究人员从土壤样品中分离并获得200个形态型纯培养菌株。结合基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)、16S rRNA基因测序、内转录间隔区(ITS)测序和脂肪酸甲酯(FAME)分析,系统鉴定了细菌和真菌的类群组成,并评估了潜在的生理适应特征。结果显示这些土壤蕴藏分类学多样的可培养细菌(27属19科37种)和真菌(至少5个分类单元),脂肪酸谱以支链和不饱和脂肪酸为主,提示膜流动性调节是应对极寒环境的重要适应策略。本研究首次综合报道了该地区冰原岛峰的可培养微生物群落,填补了南极内陆冰原岛峰微生物培养组学数据的空白。

主要技术与方法:土壤采自9个冰原岛峰(Fl?rjuven、Valterkulten、Slettfjel、Schumacherfjellet、Grunehogna、Robertskollen、Lorentzenpiggen、Vesleskarvet、Vassdalen)及企鹅聚居地;刮去表层1–2 cm后无菌收集次表层土壤。采用多种贫营养培养基(如R2A、1/10 NA、1/10 MB、ABM等)于1、4、15 °C培养2–4周以分离嗜冷或耐冷菌。细菌鉴定结合MALDI Biotyper谱图检索、16S rRNA基因测序与FAME气相色谱分析;真菌通过ITS测序鉴定。土壤理化性质引用先前发表的同一区域数据用于生态解释。

研究结果:
3.1 土壤理化特征与培养特征:有机碳0.89–1.84%、总氮约17.0–50.0 ppm、总磷14.3–45.6 ppm,pH多在6.0–7.0,元素组成呈显著位点差异。分离出的菌落颜色从白、乳脂、黄至橙,多具完整边缘、光滑表面和凸起或扁球形形态;革兰染色显示球菌和不同长度的杆菌。多数菌株在1–22 °C生长、最适约15 °C,耐受1–7% NaCl,偏好近中性pH,表明其具冷适应和中等渗透压耐性。
3.2 MALDI-TOF MS谱图分析:96株细菌中75株产生可重复的优质谱图,其中13株(7属11种)获得数据库可信匹配,其余62株为无匹配的优质谱图,21株谱图质量差。结果表明现有MALDI参考数据库对南极环境菌株覆盖面不足,本研究新增谱图对拓展数据库具有价值。
3.3 16S rRNA基因鉴定:81株高质量序列鉴定出37种细菌,隶属27属19科,以微杆菌科为主,其中节杆菌属(Arthrobacter)27株(7种)、皮球菌属(Dermacoccus)12株;同时检出变形菌门和厚壁菌门的多种菌。少数菌株与已知种相似性较低(如Rhodococcus aerolatus 95.4–95.7%、Pontibacter amylolyticus 94.7%),提示可能存在新的分类单元。
3.4 真菌ITS鉴定:10株真菌被鉴定为Samsoniella alpina、Pseudogymnoascus roseus、Tolypocladium ovalisporum、Leuconeurospora bharatiensis和Gelatinofungus brunneus。其中L. bharatiensis与此前仅在东南极Larsemann Hills报道的菌株100%相似,扩展了其已知地理分布;Pseudogymnoascus为南极土壤常见冷适应真菌。
3.5 不同冰原岛峰的空间分布:Schumacherfjellet细菌物种数最高(10种),Grunehogna最低(2种)。Dermacoccus nishinomiyaensis分布最广,见于8个采样点;而许多物种局限于单一地点。空间异质性显著,可能与局部基质、营养和暴露历史等因素有关。
3.6 FAME分析与冷适应:27株代表性菌株的FAME谱显示支链脂肪酸含量变化大(iso-型0.34–73.14%、anteiso-型0.31–94.59%),不饱和脂肪酸为0.46–95.54%。例如若干节杆菌属菌株的anteiso-C15:0占总脂肪酸约30–64%,总支链脂肪酸约64–82%;革兰阴性菌富含C16:1和C18:1等不饱和脂肪酸。这些特征与低温下维持膜流动性的同黏适应(homeoviscous adaptation)一致。

总结讨论与结论:讨论部分指出,WDML冰原岛峰可培养细菌以放线菌和变形菌为主导,与南极其他地区存在属级重叠,但各地点具有独特组合,表明环境筛选和地理隔离共同塑造群落结构。MALDI-TOF谱图作为参考数据可促进未来极地细菌鉴定。脂肪酸数据支持膜脂组成改变是重要的适应机制。结论部分确认:本研究首次报道了WDML冰原岛峰可培养微生物群落的综合特征;该区域栖息着多样化的、与寒冷环境相关的细菌和真菌;支链和不饱和脂肪酸占优势提示膜流动性调节是极地细菌存活的关键生理策略。这些发现为将来开展比较生物地理学、基因组学和代谢组学研究,并探讨利用南极冰原岛峰作为火星类似环境开展微生物生存机制研究提供了基础。
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