基于下一代测序邻近延伸分析平台对脑脊液样本的技术性能评估及冻融循环稳定性研究

《BMC Biotechnology》：Evaluating assay performance and freeze-thaw stability in cerebrospinal fluid samples using High-Throughput Proximity Extension Assay Platform

摘要

背景

脑脊液（CSF）分析有助于理解可能与疾病进展相关的大脑特异性分子变化。邻近延伸分析（PEA）已被应用于多项脑脊液研究，但该检测技术本身的评估及其冻融循环对蛋白信号的影响尚未有文献记载。本研究旨在：(1) 评估PEA平台的技术性能；(2) 评估冻融循环对PEA平台上分析物可检测性的影响。

结果

我们对采用下一代测序（NGS）读出方式的PEA技术进行了评估，并报告了在脑脊液样本中观察到的可检测性和变异系数。我们还评估了最少3次、最多9次冻融循环后的蛋白质组信号，发现随着循环次数增加，信号变化极小。

结论

本研究是首个使用NGS读出平台对脑脊液样本进行PEA性能评估的研究。我们报告了扩展面板相较于原始4个面板的蛋白检测率较低、变异性较高，但在可检测阈值以上的变异程度可接受。此外，我们的研究证明蛋白质组信号具有稳健性，并在多次冻融循环中保持持续稳定。这对临床样本的处理和分析具有重大意义，并便于对具有不同分析前条件的样本进行调查研究。