综述：宏基因组下一代测序在假体关节感染中的诊断准确性与临床考量：一项系统评价和荟萃分析

《European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases》：Diagnostic accuracy and clinical considerations of metagenomic next-generation sequencing in prosthetic joint infection: a systematic review and meta-analysis

摘要

目的

宏基因组二代测序（mNGS）已成为人工关节感染（PJI）病原体检测中一种有前景的补充方法。本系统评价与Meta分析旨在评估mNGS与传统微生物培养的 diagnostic 准确性。

方法

按照PRISMA-DTA指南进行系统评价及双变量诊断准确性Meta分析。检索PubMed、Ovid MEDLINE、Embase、WoS及CNKI数据库。纳入的研究应满足以下条件：评估可疑或确诊PJI的鸟枪法mNGS、采用公认的参考标准进行诊断，并报告足够的数据以构建mNGS与传统培养的2×2列联表。采用双变量随机效应Reitsma模型估算汇总灵敏度与特异度。

结果

共纳入14项研究，涉及1,579例病例，其中982例被归类为PJI，597例为非PJI。分别汇总分析时，mNGS的灵敏度为84.3%（95%CI 77.3%–89.4%），特异度为91.5%（95%CI 88.4%–93.9%），而传统培养分别为66.0%（95%CI 60.1%–71.4%）和95.6%（95%CI 92.8%–97.4%）。汇总受试者工作特征（SROC）曲线下面积mNGS为0.941，培养为0.930。敏感性分析未改变总体结论。

结论

分别分析时，mNGS展现出比传统培养更高的汇总灵敏度。以SROC评估的整体诊断效能两种方法相当。这些发现提示mNGS可能提供互补的微生物学信息。然而，仅由mNGS检出的微生物应谨慎解读，并结合其他临床与实验室发现进行判断。