小叶女贞(Ligustrum ovalifolium,木犀科)是一种在许多国家广泛栽培的绿篱植物。2021年12月,印度旁遮普邦Doaba地区一处私人花园中生长的小叶女贞出现了叶绿斑点及花叶症状。现场存在的粉虱及症状特征提示可能感染单双核病毒。从5株病株中采集了带病叶片样品,提取总DNA,并使用单双核病毒衣壳蛋白特异性引物进行PCR扩增(Wyatt和Brown 1996)。全部5份带病样品均扩增出约570 bp的片段,该片段经1%琼脂糖凝胶纯化后直接测序,无需克隆。对所得序列进行BLAST分析,确认存在一种与番茄叶卷Joydebpur病毒(ToLCJV)具有相似性的单双核病毒。

为进一步研究该初步鉴定出的病毒,研究人员从GenBank数据库检索了15份ToLCJV分离株的全基因组序列并进行比对。基于比对序列中的保守区域设计了病毒特异性引物。引物TLCV-AF(5'-GAGGTCAGCAATCTGCCAAC-3')和TLCV-AR(5'-CTCTAGCTGATCTTCCATCG 3')用于扩增约1.7 kb的ToLCJV部分基因组片段。PCR扩增条件如下:94 °C预变性3 min(1个循环),随后进行30个循环,每个循环包括94 °C 1 min、56 °C 40 s、72 °C 3 min 15 s,最后72 °C延伸7 min。全部5份带病样品均获得约1.7 kb的PCR产物,将其克隆至pGEM?-T Easy载体(Promega,美国)中,经纯化后进行测序。利用ORF Finder和BLASTP分析对所获序列进行了分析。所得序列修剪至1691个核苷酸,并提交至NCBI GenBank数据库,登录号为OQ128010。BLAST分析显示,该鉴定出的分离株与ToLCJV(GenBank登录号HM007098)具有98.76%的核苷酸一致性。ToLCJV感染L. ovalifolium的发现扩展了该病毒的已知寄主范围。据我们所知,这是ToLCJV感染L. ovalifolium的首次报道。