成年雌性山羊33个组织基因表达图谱的构建与质量验证

《Scientific Data》：An atlas of gene expression in the adult female domestic goat (Capra hircus)

　　

摘要

基因表达图谱是将转录本丰度与结构同组织生物学联系起来的重要资源。本研究的目的是构建成年雌性家山羊（Capra hircus）基因表达的综合性图谱。为此，我们提取并测序了来自六只穆尔西亚-格拉纳迪纳山羊的33个组织的总RNA。平均每个样本获得超过5400万条双端原始读段（2×150 bp），其中92.5%成功比对至山羊参考基因组ARS1。随后进行了下游分析，以确保通过上述程序生成的基因表达图谱的质量。样本聚类发现7个异常样本，已从数据集中剔除。此外，第二次主成分分析表明，功能相关的组织倾向于聚集在一起，形成界定清晰的簇，同时脑组织、肌肉组织和垂体组织表现出强烈的转录特征。这些发现与此前的报道高度一致，为本研究中生成的转录组资源的高可靠性提供了证据。