多组学解析B细胞激活的动态状态及其与免疫介导性疾病相关的调控机制

《Nature Communications》：Multi-omics profiling of primary human B cells activated via distinct stimuli

　　B细胞对免疫和免疫介导性疾病（IMD）至关重要，但不同的信号通路如何在不同时间驱动多样化的激活反应，目前尚无全面了解。本研究从27名女性健康供体中获取外周血B细胞进行体外刺激，利用RNA测序、结合表面蛋白标记的单细胞RNA测序（CITE-seq）以及ATAC测序在多个时间点对响应进行刻画。我们使用了多种刺激条件，包括B细胞受体（BCR）激活、Toll样受体7（TLR7）、TLR9、CD40以及分化为双阴性2（DN2）IgD?CD27?CD11c?CD21? B细胞，分析揭示了激活依赖的B细胞状态、刺激特异性转录因子和调控区域、IMD相关基因表达的动力学响应，以及与IMD遗传风险相关的特异性开放染色质区域。此外，我们还在调控TNFSF4表达的增强子中鉴定出一个红斑狼疮风险变异。分析数据可通过交互式浏览器获取：https://mgalab.shinyapps.io/bcellactivation。我们的研究结果强调了全面剖析B细胞激活通路对于理解健康与疾病状态下的B细胞生物学可能具有重要意义。