摘要
厌氧菌痤疮丙酸杆菌（Cutibacterium acnes）长期以来被认为参与痤疮的发病过程。该物种包含三个亚种，其中acnes亚种下有四种型别，分别命名为IA1、IA2、IB和IC，其已报道的临床关联各不相同。然而，16S核糖体RNA基因的扩增子调查显示，患病皮肤和健康皮肤中痤疮丙酸杆菌属（Cutibacterium）的丰度普遍相似，而这一现象究竟反映的是皮肤状态本身还是标记基因检测的局限性，尚未对各分类单元进行量化评估。研究者检索了痤疮丙酸杆菌的基因组组装数据，共包括2236个C. acnes和71个C. granulosum的组装序列，并通过八基因多位点序列分型对各分类单元进行归类。研究者提取了全长16S基因以及V1–V3、V3–V4和V4区序列，评估了各区段分辨六个分类单元的能力，并对三个已发表的队列进行了重新分析。在每个短区段中，96%至98%的组装中，单一相同序列即可涵盖所有六个分类单元。通过全长16S基因检测，defendens亚种和elongatum亚种分别在其94%的组装中可被检出，而acnes亚种内的四种型别检出率则不足5%。因此，16S基因扩增子检测无法区分acnes亚种内的各型别，而当细菌负荷确实存在差异时，仅属水平的差异可能因试剂来源而被误报为生物标志物。在分型队列中，痤疮皮肤中defendens亚种比例较低而IA2型别比例较高；而在鸟枪法测序队列中，仅青春期后IA1型别存在显著差异。因此，究竟是IA2型别而非IA1型别能够区分痤疮皮肤，仍有待进一步确认。
