卵巢癌巴豆酰化相关转录评分揭示成纤维细胞富集、ECM活跃的侵袭性肿瘤生态微环境
《Biomedicines》:Wound Healing: From Mechanisms to Therapeutic Approaches
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时间:2026年10月24日
来源:Biomedicines 4.5
摘要
背景:赖氨酸巴豆酰化 (Kcr) 是一种对代谢具有响应性的修饰,但与卵巢癌中巴豆酰化相关转录本相关的细胞生态系统仍未得到充分表征。 方法:整合了三个卵巢癌单细胞队列以定义巴豆酰化相关转录评分 (CRTS)。我们检查了细胞组成、恶性细胞程序,推断配体 - 受体通信,并在 bulk 队列中评估了 12 基因生存关联指标。空间转录组学、SHAP、癌症依赖性图谱和虚拟基因敲除被用于探索性三角验证。 结果:高 CRTS 细胞与低 CRTS 细胞相比,包含相对更多的成纤维细胞和恶性细胞,以及较少的 CD8+ T 细胞。在恶性细胞中,EMT、侵袭和转移模块评分更高(所有名义细胞水平 p < 0.0001),且 CRTS 与侵袭(rho = 0.269)和转移(rho = 0.252)相关。CellChat 推断出 1915 对 519 种相互作用,高 CRTS 组中 ECM 相关信息流更强。一个 12 基因模型在评估的患者队列中分层了生存情况,并与预测的较高免疫排斥相关。WTAP、SIRT2 和 ALDH5A1 被模型解释和计算机模拟扰动优先确定。九个模型基因在一个空间切片中与推断的成纤维细胞丰度相关(rho 约为 0.37–0.62;报告的名义斑点水平 p < 0.05)。 结论:CRTS 标记了一个成纤维细胞富集、ECM 活跃的卵巢癌转录生态系统,与侵袭性恶性细胞程序和预测的免疫排斥相关。结果支持了可检验的假说,但并未确立直接的 Kcr 修饰、患者水平生态系统重塑或分子因果关系。
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