简要总结
泛连接蛋白1（Panx1）是一种参与细胞间通讯的膜通道。我们在一个公开的鼠标卒中数据集里查找了它的RNA出现位置，并在另一个独立脑组织数据集中对比了相关基因的表达模式。Panx1 RNA只在很小比例的细胞中被检出。它在不同细胞类型中的分布有所不同，但对三个卒中样本和三个假手术样本的对比未能提供个体细胞类型内发生变化的有力证据。描述性分析显示，检出Panx1的细胞分布于多种髓系转录状态中。另一份独立组织数据集显示出炎症性基因表达模式，但Panx1本身并没有相应升高。这些观察有助于为后续实验确定细胞背景，但并不能证明Panx1蛋白增加、通道活性增强或在卒中损伤中起因果作用。
摘要
泛连接蛋白1（Panx1）参与ATP释放和炎症信号传导，但缺血性卒中后其在转录水平上的分布仍未得到充分刻画。我们结合了针对280篇文献的专题文献计量分析，对GSE174574的重新分析（包含24小时采集的3个假手术样本和3个大脑中动脉闭塞（MCAO）小鼠脑样本），以及利用GSE58720（包含假手术组、MCAO组和MCAO加血管内皮生长因子（VEGF）组各3个样本）进行的支持性组织水平比较。经过筛选的单细胞图谱共包含58,333个细胞，其中640个细胞可检出Panx1转录本。采用样本感知的比较方法，包括等权重样本比例、精确置换检验以及分别计算的Welch置信区间。MCAO与假手术组在活化小胶质细胞检出率上的差异为1.153个百分点（95%置信区间0.150–2.155；精确p值=0.10；Benjamini–Hochberg校正后p值=0.433）。Slingshot描述了髓系状态空间结构，其主分支包含10,492个细胞，其中10,487个为小胶质细胞。在整体组织水平上，Panx1的系数在处理后的矩阵尺度上为?0.311（校正后p值=0.435），而探索性的16基因髓系/炎症基因面板在MCAO组中的平均得分更高（差值1.363；精确及校正后p值=0.10）。从该基因面板中去掉Panx1后，方向性保持一致。研究结果描述了Panx1转录本的稀疏、异质检出情况以及伴随的炎症模式，但每组仅3个样本使得组间推断十分有限。研究结果不能确立Panx1特异性的转录程序、生物学进展、蛋白诱导或通道激活。
