摘要
恶臭克雷伯菌是一种新出现的条件致病菌，能够引起奶牛乳房炎和新生儿定植。本研究对乳制品供应节点和儿科宿主基质中的恶臭克雷伯菌进行了全面的分子和表型特征分析，并评估了一种基于益生菌的生物干预策略。在埃及检查的140份样本中，从27.9%（39/140）的乳制品供应节点和婴儿粪便样本中分离出恶臭克雷伯菌，临床乳房炎乳汁（40.0%，8/20）和婴儿粪便样本（40.0%，8/20）中的峰值流行率相同。观察到高比例的多重耐药性（MDR；66.7%，26/39），所有菌株（100%）均确认为超广谱β-内酰胺酶（ESBL）产生菌。黏菌素（CT）和阿奇霉素的总体耐药率达到46.2%（18/39），在商业牛奶中达到峰值（CT耐药率为69.2%）。分子筛查显示移动性黏菌素耐药基因mcr-1的高频率（41.0%，16/39）和ESBL决定子blaCTX-M（66.7%，26/39），以及菌毛黏附（mrkA，76.9%）和铁获取（kfuBC，82.1%）位点。所有菌株（100%）均表现出强烈的生物膜形成能力（平均OD570 = 0.63 ± 0.016），而毒素-抗毒素（TA）模块（symE、ccdB、relE）与MDR表型呈正相关（p = 0.024）。细菌毒力基因负担与宿主组织损伤和炎症标志物之间存在强烈的统计学关联，包括乳汁乳酸脱氢酶（LDH；r = 0.918）、触珠蛋白（r = 0.954）以及新生儿粪便钙卫蛋白（FC；83.34 ± 21.13 μg/g vs. 对照组22.4 ± 2.0 μg/g，p = 0.02）。重要的是，来自嗜酸乳杆菌的基于牛奶的无细胞代谢上清液（CFS）表现出优于基于肉汤的CFS的拮抗活性（针对CT耐药菌株的抑菌圈直径高达40 mm vs. 12 mm）。计算机分子对接预测，推测的嗜酸乳杆菌生物活性肽（Acidocin 8912得分：?108.07 kcal/mol；Acidocin B得分：80.63 kcal/mol）与恶臭克雷伯菌外膜孔蛋白CymA和转运靶标具有强结合亲和力。这些发现强调了在食品和儿科基质中共存的强韧恶臭克雷伯菌谱系，并展示了益生菌衍生CFS作为同一健康框架下非抗生素控制策略的治疗潜力。
