摘要
下一代测序技术已经深刻改变了精准肿瘤学，然而基因组改变仍然主要被解释为二元事件：存在或不存在，可操作或不可操作。变异等位基因频率（VAF），即携带特定变异的测序reads所占比例，为基因组分析引入了额外的定量维度。然而，VAF并非肿瘤克隆性的直接衡量指标，因为它受到肿瘤纯度、拷贝数改变、突变多样性、倍性、样本类型的影响，而在循环肿瘤DNA（ctDNA）中，还受肿瘤脱落和疾病负荷的影响。在本叙述性综述中，我们探讨了VAF在肺癌、乳腺癌和结直肠癌中的生物学及临床意义，重点关注其潜在的预后和预测作用以及治疗期间的动态变化。现有证据主要来自回顾性和异质性研究，提示VAF与临床结局之间可能存在潜在关联，特别是在基于血浆的分析中。然而，这些发现主要支持探索性预后关联，而非确立经验证的临床实用性，同时VAF预测基因型匹配治疗获益程度的能力仍缺乏充分证明。纵向VAF评估可能为分子应答、残留疾病和治疗驱动的克隆进化提供额外见解，但其独立的临床价值仍需进一步前瞻性验证。分析变异性、生物学混杂因素、异质性阈值以及缺乏标准化方法，进一步限制了VAF的临床解释与应用。因此，VAF可能代表基因组分析的互补定量维度，而非取代突变阳性状态，有望有助于更精细地理解肿瘤异质性和分子进化，前提是通过对临床有效性和实用性进行适当设计的前瞻性研究加以确立。
