侵袭性人源猪链球菌感染的临床特征、90天功能结局、药物敏感性及探索性基因组分析:中国多中心回顾性研究

《International Journal of Infectious Diseases》:Clinical Characteristics, 90-Day Functional Outcomes, Antimicrobial Susceptibility, and Exploratory Genomic Analysis of Invasive Human Streptococcus suis Infection: A Multicenter Retrospective Study in China

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年10月24日 来源:International Journal of Infectious Diseases 4.6

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  猪链球菌(Streptococcus suis)是一种与猪及猪肉接触相关的人畜共患病原体,可通过破损皮肤接触及食用未煮熟的猪肉传播。侵袭性疾病包括脑膜炎、菌血症、心内膜炎、关节炎、脓毒性休克及多器官功能障碍;存活者可能出现持续性听力或前庭功能障碍。人类感染遍布

  
猪链球菌(Streptococcus suis)是一种与猪及猪肉接触相关的人畜共患病原体,可通过破损皮肤接触及食用未煮熟的猪肉传播。侵袭性疾病包括脑膜炎、菌血症、心内膜炎、关节炎、脓毒性休克及多器官功能障碍;存活者可能出现持续性听力或前庭功能障碍。人类感染遍布全球,亚洲地区疾病负担最重,该地区职业性生猪接触及相关食品处理习惯较为普遍。 许多亚洲研究为单中心或区域性病例描述,长期功能结局尚未被充分阐明。由于缺乏猪链球菌特异性药敏折点,且需对脑脊液宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing, mNGS)支持培养阴性的感染病例进行判定,结果解读进一步复杂化。整合90天结局、标准化最低抑菌浓度(minimum inhibitory concentration, MIC)判读及临床分离株基因组学的多中心研究较少。 研究人员对中国四个省份八家医院收治的34例侵袭性人源猪链球菌感染患者进行回顾性分析,描述临床特征与90天结局,使用替代折点重新判读原始MIC,并对可回收分离株进行基因组学表征。第90天时,34例中17例死亡或存在持续性后遗症;32例存活者中12例记录到听力相关后遗症。本队列中,急性耳蜗前庭受累仅见于脑膜炎病例。受试β-内酰胺类药物在替代折点下显示体外活性。六个猪链球菌基因组呈现三种序列型(sequence type, ST)及标志物变异。
侵袭性人源猪链球菌(Streptococcus suis)感染是一种与猪及猪肉接触密切相关的人畜共患病,临床可表现为脑膜炎、菌血症、心内膜炎、关节炎、脓毒性休克及多器官功能障碍,存活者常遗留持续性听力或前庭功能损害。尽管亚洲地区疾病负担最重,但多数研究局限于单中心或区域性病例,长期功能结局数据不足;同时,猪链球菌缺乏物种特异性药敏折点,培养阴性病例需依赖脑脊液宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing, mNGS)辅助判定,这些因素均制约了临床认识与治疗优化。为此,研究人员在中国四个省份八家医院开展了一项多中心回顾性研究,纳入2017年11月至2025年12月期间收治的34例侵袭性人源猪链球菌感染患者,旨在系统描述临床特征与90天功能结局,采用替代折点重新判读原始最低抑菌浓度(minimum inhibitory concentration, MIC),并对可回收临床分离株进行基因组学探索。
研究结果显示,该队列以中老年男性为主,中位年龄55岁,76.5%为男性;61.8%的患者有明确的猪或猪肉接触史,接触途径包括手部损伤后接触、处理冷藏或冷冻猪肉、接触病猪或死猪、食用未煮熟猪肉、购买或清洗猪肉及接触活猪;中位潜伏期为28.5小时,从症状出现到病原学诊断的中位时间为5.0天。临床分型方面,79.4%的患者为脑膜炎,20.6%为非脑膜炎性菌血症或脓毒症;发热见于79.4%的患者,脑膜刺激征占55.9%,脑实质受累占41.2%,急性耳蜗前庭受累占32.4%,且全部11例急性耳蜗前庭受累者均属于脑膜炎组。严重并发症包括脓毒性休克4例、急性肾损伤4例、感染性心内膜炎2例、关节炎3例。病原学诊断方面,血培养阳性率为79.4%,脑脊液培养阳性率为50.0%,脑脊液mNGS阳性率为20.6%,3例仅凭mNGS确诊。90天结局显示,17例(50.0%)存活且无后遗症,17例(50.0%)结局不佳,包括听力损失7例、耳聋5例、关节炎2例、癫痫1例及死亡2例;32例存活者中12例(37.5%)存在听力相关后遗症。单因素比较显示,急性耳蜗前庭受累仅出现在结局不佳组(64.7%对0.0%,非有限比值比,精确95%置信区间4.81至无穷,P<0.001);结局不佳组血小板计数更低(153对202×10?/L,P=0.036),糖皮质激素使用更频繁(52.9%对11.8%,比值比8.44,精确95%置信区间1.22至92.37,P=0.026);脑实质受累在数值上更多见于结局不佳组(58.8%对23.5%,比值比4.64,精确95%置信区间0.87至27.20,P=0.080),但差异未达统计学显著。
药敏结果显示,21株具有原始MIC的分离株在采用临床和实验室标准协会(Clinical and Laboratory Standards Institute, CLSI)M100第36版(2026)草绿色链球菌群替代折点判读后,青霉素MIC范围为0.03至0.12 mg/L,MIC50和MIC90分别为0.06和0.12 mg/L,全部21株均为敏感;头孢噻肟19/19株敏感,头孢曲松5/5株敏感,左氧氟沙星、万古霉素及美罗培南在可判读菌株中均敏感;红霉素、克林霉素和四环素耐药率分别为85.0%、80.0%和100.0%。
基因组分析方面,对6株可回收临床分离株进行全基因组测序(whole-genome sequencing, WGS)及多位点序列分型(multilocus sequence typing, MLST),鉴定出ST1(SS01、SS04、SS06)、ST7(SS03、SS05)和ST25(SS02)三种序列型;读段依赖性荚膜分型预测5株为血清2型、1株为血清14型。代表性ST1分离株SS01染色体为2,078,452 bp环状基因组。毒力相关基因检测显示,epf和sly各在5株中检出;mrp在SS01、SS02、SS03和SS05中检出,在SS04和SS06中未达到检出标准。两株ST7分离株均为epf?/sly?/mrp?,ST1分离株在mrp检出上存在差异,SS02(ST25)为epf?/sly?/mrp?。七基因组比较保留了1,974,919个可调用位点和2,532个变异位点,SNP密度掩蔽后保留1,782,628个位点和405个SNP;SS05与CS100322/SC070731的SNP距离为89至92个,与98001/SC84为154至166个;SS03与上述参考基因组距离分别为119至120个和124至136个。SS03和SS05对SC84 89K区间呈片段化覆盖(≥1×覆盖率分别为40.9%和38.7%),中位深度为零,未检出符合标准的salR或salK覆盖。
讨论部分指出,本队列中61.8%的患者有明确猪或猪肉接触史,支持在发热、头痛、意识改变或脓毒症于猪或猪肉接触后短期内出现时考虑猪链球菌感染。死亡率(5.9%)低于中国主要ST7暴发疫情报告的水平,但存活者中37.5%存在听力相关后遗症,提示存活并不能完全反映疾病负担,随访应包含听力学、前庭功能及神经系统评估。急性耳蜗前庭受累与90天结局不佳的关联需谨慎解读,因为复合结局包含持续性听觉或前庭后遗症,急性受累与持续性后遗症是相关但不同的表现;零单元格导致非有限比值比,无法获得有限效应估计。药敏结果应视为替代折点框架下的体外证据而非猪链球菌特异性临床药敏结论;本队列中青霉素和第三代头孢菌素在体外显示良好活性,而红霉素、克林霉素和四环素高耐药率不支持将其作为疑似侵袭性猪链球菌感染的单一经验治疗。糖皮质激素使用与结局不佳的关联可能反映对更严重脑膜炎或早期听觉症状的治疗而非治疗危害。ST1和ST7是流行病学上重要的侵袭性谱系,但本研究中ST1和ST7病例均出现不良结局,唯一ST25病例(SS02)尽管发生心内膜炎、脑梗死并接受手术,仍存活且无记录后遗症;小样本量和按分离株可回收性选择限制了基于ST的严重程度排序。两株ST7分离株的epf?/sly?/mrp?谱与国内暴发相关ST7分离株报道一致,但不能据此确立暴发克隆身份。SS05在所选参考面板中与CS100322和SC070731的SNP距离小于与SC84和98001的距离,SS03无法被明确归属至已发表的ST7亚谱系;89K片段化映射不支持完整的SC84样区域,但不能排除分歧同源物或确立减毒表型。
研究结论为:侵袭性人源猪链球菌感染在本队列中常表现为脑膜炎,并与显著的90天发病率相关,支持进行结构化听力学随访;在具有可用原始MIC的分离株中,青霉素和第三代头孢菌素在替代折点下显示体外活性;本测试亚组中对红霉素、克林霉素和四环素的高耐药率不支持将其作为疑似侵袭性猪链球菌感染的经验性单一治疗;临床关联和基因组发现仍属探索性,不能确立独立的预后价值或基因型-表型因果关系。
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