西班牙猪群A型流感病毒2019-2022年进化与基因组多样性研究：重配事件与人畜共患风险分析

《Virus Evolution》：Zoonotic infections and genomic evolution of novel reassortant swine influenza A viruses in Spain

　　

摘要

A型流感病毒（IAV）在欧洲猪群中广泛传播，并通过人类频繁引入病毒后在猪群内部发生重配而持续多样化。西班牙因其集约化白猪养殖、散养伊比利亚猪系统以及大量野猪种群的共存，构成了一个尤为动态的生态环境。本研究对2019年至2022年间西班牙猪群中IAV的进化与基因组多样性进行了综合分析，是对此前2016年至2019年监测工作的延续。在24个省份开展的采样共获得了66条来自伊比利亚猪和白猪的新全基因组序列。

我们鉴定了18种基因型，其中包括11种此前未在本研究监测中检测到的新型重配株。若干基因型，如H1N2 G21和G22、H3N2 G23以及罕见的H3N1 G12，为该国家所特有。在托莱多和巴达霍斯地区，部分基因型同时被检测于白猪、伊比利亚猪和野猪中，表明猪群之间存在病毒传播流动。

系统发育分析揭示，人类H1N1pdm09病毒持续传入猪群，并产生了至少五种重配基因型（G10、G16–G19）。这些谱系整合了大流行内部片段，在某些情况下还包含人流感季节性N2片段，凸显了人类作为病毒入侵来源的持续作用。相反，2022至2026年间在西班牙检测到的四例人畜共患感染（H1N1v）与在白猪中流行的基因型相关联，强调了人-猪界面IAV传播的双向性。

总体而言，本研究证明西班牙为IAV的多样化、重配及人畜共患风险提供了有利的生态条件。研究结果进一步强调了持续实施“同一健康”监测的必要性。