两种东南亚鱿鱼主要器官微生物组结构及优势菌群分析

《microLife》：Organ-specific microbiomes reveal strong bacterial compartmentalization in two tropical squid species

　　

摘要

除了已知较为明确的短尾鱿鱼发光器官与发光细菌Aliivibrio fischeri之间的共生关系外，其他头足类动物组织相关的微生物组仍未得到充分研究。在此，我们研究了两种东南亚鱿鱼物种Uroteuthis chinensis和Sepioteuthis lessoniana主要器官（如皮肤、肠道、鳃和产卵腺）中的细菌群落。由于在我们的采样设计中宿主物种和环境/时间因素存在混杂，我们重点关注不同器官之间的微生物组差异，而非区分它们的各自贡献。细菌群落具有显著的解剖结构特征，每个器官都拥有独特的微生物组。在U. chinensis中，鳃部菌群以Endozoicomonas为主；而在S. lessoniana的肠道中，Mycoplasma占据主导地位。两种鱿鱼的产卵腺中富含Ruegeria和Pikeienuella；皮肤菌群则表现出明显的物种间差异：U. chinensis的皮肤菌群以Sphingomonadales和Vibrionales为主，而S. lessoniana的皮肤菌群则包含更多样的微生物，包括Micrococcales、Hyphomicrobiales和Flavobacteriales。这些研究结果首次详细描述了鱿鱼主要器官中的微生物组结构，并为未来探讨宿主相关细菌在头足类动物中的生态和功能作用提供了基础。