在猪痢疾监测中首次确认新型短螺旋体菌种Brachyspira burroughii

《BMC Microbiology》：Brachyspira burroughii sp. nov., a novel intestinal spirochete isolated from pigs during swine dysentery surveillance: genomic and phenotypic characteristics

　　

摘要

背景

Brachyspira hyodysenteriae（猪痢疾短螺旋体）是猪痢疾（SD）的经典病原体；然而，如B. hampsonii 和B. suanatina 等强β溶血菌种也会引起类似 SD 的疾病，并使监测和诊断复杂化。来自两个不同养猪场的粪便样本被提交至艾奥瓦州立大学兽医诊断实验室进行 SD 监测。所得分离株呈弱β溶血性，MALDI-TOF 将其鉴定为B. hyodysenteriae 或其他Brachyspira 属菌种，但置信度评分较低（1.80–1.90）。针对已知菌种的 PCR 检测也无明确结论。因此，我们结合了经典表型特征分析与基于基因组的分析，以确立这种新型Brachyspira 菌种的独特性。

结果

这两个分离株共享相同的生化与酶学特征谱，且明显不同于B. hyodysenteriae 和B. pilosicoli。形态学上，它们符合该属预期的尺寸和结构范围，每个细胞观察到 8–11 根周质鞭毛。平均核苷酸一致性分析显示，它们与已知菌种的相似性仅为 76.5–91%，支持将其定为新种。两个分离株之间的成对 ANI 为 94.5%，略低于传统的种界定阈值。核心基因组 SNP 系统发育分析将分离株置于一个独特且支持度较高的进化枝，这一发现也得到了基于nox 的系统发育分析的支持，而 16S 和 23S rRNA 基因分析在某些Brachyspira 属菌种之间的鉴别分辨率较低。

结论

这些发现揭示了一种在常规 SD 监测中独立识别出的此前未被认知的Brachyspira 菌种。对Brachyspira burroughii 的确认突显了结合基因组分析与经典表型分析对于提高新型Brachyspira 属菌种检测和准确鉴定的重要性。