从人类鼻咽部分离的可能新型螺旋球菌埃卡皮螺旋球菌的初步表征

《BMC Microbiology》：Initial characterisation of Helcococcus ekapensis isolated from the nasopharynx of infants in Western Cape, South Africa

　　

摘要

背景

鼻咽部是共生菌和病原菌的主要储存库，越来越多的证据表明其微生物组成与呼吸健康及疾病易感性相关。在此，我们报道了一种可能属于新种的螺旋球菌（Helcococcus）的分离和初步表征，暂命名为埃卡皮螺旋球菌（Helcococcus ekapensis）。菌株分离自存档的鼻咽部样本，这些样本来自南非德雷肯斯坦儿童健康研究（Drakenstein Child Health study）所收集的样本。尽管螺旋球菌属已在人体呼吸道中被鉴定，但该属在人类鼻咽部中的特征仍研究不足。

结果

我们描述了三个H. ekapensis菌株——SA-HE-C1、SA-HE-207和SA-HE-338——的分离和培养过程，并报告了其菌落和细胞形态。我们的流行率筛查显示，婴儿鼻咽部H. ekapensis的定植率随年龄增长在出生后的第一年逐渐增加。此外，我们报告了这些菌株的三个草图基因组，其平均核苷酸一致性接近99%。基因组分析揭示了其代谢能力有限，包括不完全的氨基酸生物合成途径。此外，还鉴定出几个推定基因，包括ABC型转运蛋白和细菌素样基因。

结论

综上所述，本研究提供了一个从人类鼻咽部分离的可能新型Helcococcus分类单元的初步表型和基因组表征，并强调了其在发育中的婴儿鼻咽微生物组中的潜在重要性。这些发现为未来研究其在鼻咽部中的作用提供了基础，并有待进行正式的分类学描述。