广宿主痘病毒衣壳基因在鳞翅目宿主及地理区域间的低变异性

《Archives of Virology》：Low variability in the capsid gene of a generalist densovirus across lepidopteran hosts and geographic regions

　　摘要病毒存在于所有生态系统中，昆虫可作为模式宿主系统，帮助我们理解其地理分布范围和宿主特异性。鳞翅目昆虫相对容易采集和饲养，且已知可携带多种病毒病原体。关于鳞翅目病毒的研究大多集中在杆状病毒上，但随着测序技术的进步，这一情况正在开始改变。在本研究中，我们利用基因工具来表征珠弄蝶细小病毒（JcDV，小病毒科、细小病毒亚科、原始歧主细小病毒属、种加词鳞翅目1）的宿主和地理分布范围。利用宿主组织和幼虫粪便，我们对来自北美、中美洲和南美洲11个地点的25个鳞翅目科进行了JcDV的筛选。我们在11个鳞翅目科的粪便中检测到了JcDV，这些样本来自新热带界和近北极界两个生物地理区。为了表征所检测病毒的遗传变异，我们对10个粪便样本以及来自凤蝶总科三个科的另外56只鳞翅目昆虫尸体中的病毒衣壳基因片段进行了Sanger测序。在所有获得的序列中，与牛津参考基因组的平均序列一致性为99.85%，在我们样本内部的平均一致性为99.77%。与参考序列相比，我们发现了18个核苷酸变化，被表征为10种JcDV单倍型变异体。这些差异导致了7个氨基酸替换，且不能被样本类型（粪便或尸体组织）、地理位置或鳞翅目宿主科预测。最终，我们得出结论：JcDV是一种广泛分布的病毒，许多鳞翅目科在其自然环境中都会接触到这种病毒，且JcDV的衣壳基因在地理空间和鳞翅目宿主物种间具有良好的遗传保守性。