伊朗屠宰场牲畜中肝片形属（Fasciola）物种的cox1基因遗传多样性及单倍型网络分析

《Parasitology Research》：High haplotype diversity and recent population expansion of Fasciola hepatica in Iran: Insights from cox1 mitochondrial analysis

　　

摘要

肝片形虫科吸虫病（Fascioliasis）是一种全球分布的人畜共患病，对兽医学和公共卫生构成严重威胁，在伊朗地区高度流行。了解该国各地种群结构、遗传多样性和单倍型分布的信息，对制定防控和药物抗性管理策略具有重要意义。因此，本研究旨在评估伊朗屠宰场牲畜中肝片形属（Fasciola）物种的遗传多样性，并确定全国范围内的单倍型网络。从七个省份收集的20个寄生虫样本中，扩增并测序了线粒体细胞色素c氧化酶I（cox1）基因。BLAST分析确认17个分离株为牛肝片吸虫（F. hepatica）（同源性为94.75%至99.74%），3个分离株为巨片吸虫（F. gigantica）（同源性为98.36%至99.12%）。在牛肝片吸虫中，鉴定出9个新型单倍型，包含60个变异位点，单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.926和0.047。在巨片吸虫中鉴定出3个单倍型，单倍型多样性和核苷酸多样性分别为1.00和0.017。中性检验（包括Tajima's D（-0.606）和Fu's Fs（3.75））表明牛肝片吸虫种群近期未发生人口扩张。通过将本研究获得的牛肝片吸虫序列与此前发表的伊朗序列合并，构建了基于cox1基因的国家数据集，共包含187条序列，揭示了13个省份中49个不同的单倍型，其中H11为进化核心单倍型。Tajima's D和Fu's Fs的显著负值（分别为-2.515和-33.27）进一步证实了近期种群扩张的模式。本研究发现表明伊朗肝片形属种群具有丰富的遗传多样性，为设计有针对性的流行病学防控和监测方案提供了宝贵的数据。