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网格蛋白介导的内吞(clathrin-mediated endocytosis, CME)是真核细胞通过形成质膜来源囊泡内化信号因子、营养物质和膜蛋白等多种分子的过程。该复杂机制涉及支架蛋白网格蛋白(clathrin)及50余种其他内吞蛋白在内吞位点的协调组装
网格蛋白介导的内吞(clathrin-mediated endocytosis, CME)是真核细胞通过形成质膜来源囊泡内化信号因子、营养物质和膜蛋白等多种分子的过程。该复杂机制涉及支架蛋白网格蛋白(clathrin)及50余种其他内吞蛋白在内吞位点的协调组装。网格蛋白聚合成坚固的超分子晶格(supramolecular lattices),但其组装高度动态并受DnaJ/Hsc70解包被机器(uncoating machinery)调控。尽管早期提出内吞位点的网格蛋白周转(clathrin turnover)可允许膜形变(membrane deformation)发生,但更近期研究开始提示其可能具有调控功能。本综述中,研究人员总结并讨论推进对网格蛋白动态所发挥作用理解的关键发现,以期阐明内吞过程的复杂调控。
1 引言
网格蛋白介导内吞(clathrin-mediated endocytosis, CME)是真核细胞选择性摄取激素、跨膜蛋白、脂质和营养物质等的主要途径,在真核谱系中高度保守。该过程依赖50余种蛋白在内吞位点有序组装,完成位点起始、货物选择与捕获、质膜向内形变及囊泡剪切,随后囊泡快速脱被并与内体融合。早期电镜研究描述内吞小窝和囊泡的刷状被,随后鉴定网格蛋白(clathrin)为主要成分;尽管关键蛋白、脂质和结构特征已被详细描述,控制其动态组装的参数仍不清楚。综述聚焦内吞位点网格蛋白组装的动态属性及其可能调控内吞进程,讨论网格蛋白交换在膜形变、货物招募和位点空间组织中的可能作用。
2 内吞过程中网格蛋白衣被的组装与解组装
2.1 网格蛋白及网格蛋白晶格的结构
网格蛋白以三脚蛋白复合体(triskelion)形式高度保守,由3条重链和3条轻链组成,可自发组装为细胞内最小网格蛋白组装体。重链含N端末端结构域(terminal domain)、踝部(ankle)、远端段(distal segment)、近端段(proximal segment)、三聚化结构域及C端短无结构尾部;三脚形态中末端结构域位于三条“腿”末端并朝向凹面。腿整体坚固但膝部和远端段可弯曲,导致末端结构域大范围位移,使网格蛋白自组装成不同曲率和大小的多边晶格,依赖远端-近端腿相互作用。晶格曲率由六边形阵列中五边形开口数决定:0为完全六边形平面,12为完全闭合笼;六边形数量决定整体尺寸。曲率增加需五边形数增加,并依赖单个triskelion的大规模重排,因此衣被需具动态性;但组装动态与膜形变关系仍不清楚,体外重建难以复制细胞内调控复杂性。
2.2 网格蛋白笼解包被机制
新生内吞囊泡脱被对其与目的地融合至关重要;网格蛋白篮在体外高度稳定,需ATP依赖的解包被机器。该机器包括特异性结合网格蛋白的DnaJ蛋白(哺乳动物auxilin 1/2,即神经元auxilin及其广泛表达同源物GAK;酿酒酵母Swa2;拟南芥AUXILIN-LIKE1/2)和Hsc70家族ATP酶。哺乳动物结构研究显示auxilin结合重链末端结构域并招募Hsc70至三脚顶点下方C端无结构区的QLMLT基序,ATP水解后复合物解离。机制包括“空间楔入”模型:auxilin结合踝部交叉处,诱导构象变化和晶格应变,暴露C端以刺激Hsc70 ATPase;以及熵拉动和碰撞压力模型:Hsc70在组装的网格蛋白腿壁附近反复熵拉/推,累积应变并驱动triskelia分离。两者均提示auxilin将Hsc70定位至有利解组装位点。囊泡剪切后auxilin招募爆发及酵母DnaJ缺失导致胞质CCV脱被缺陷已确立;但早期EM显示网格蛋白晶格大规模重组,与网格蛋白聚合物高度稳定相矛盾。早期固定细胞EM可能受样品制备影响或对应不同结构;动态CCP与稳定网格蛋白斑块共存,斑块非内吞位点而与黏附/结构功能相关。需在活细胞中理解动态属性。
2.3 内吞位点形成过程中的网格蛋白动态
活细胞荧光和荧光恢复后光漂白(FRAP)显示哺乳动物细胞网格蛋白在内吞位点周转,轻链A(LCa)、轻链B(LCb)和重链恢复时间常数分别约18.9±1.0、10.6±1.9和15.9±1.0 s;单个位点约60%为可移动组分;重链和轻链交换速率相似,提示周转单位主要是triskelion而非独立链。早期和晚期CCP均可见周转。裂殖酵母单分子斑点(SiMS)显示单分子平均驻留时间约1.5 s,提示保守。ATP耗竭同时阻止网格蛋白周转和内吞,说明解包被机器不仅参与最终CCV解组装,也参与衣被形成早期。Eps15/酵母Ede1、AP-2和酵母Las17等也快速周转,但仅网格蛋白显示ATP依赖的外部调控组装需求;这种保守的能耗周转提示其可能调控内吞进程,具体功能未完全阐明。
3 网格蛋白周转是否为解包被效率与特异性之间的折中?
一种解释是解包被机器被招募至生长中的内吞位点,是高效快速CCV脱被与对组装网格蛋白结构特异性之间的进化折中。Hsc70单独不能解组装网格蛋白笼,需网格蛋白特异性DnaJ;DnaJ与Hsc70结合重链相反末端,限制解包被复合物仅形成于组装结构。示踪显示内吞囊泡与早期内体融合常在摄取后约1–2 min内;体外估计[Hsc70]依赖的CCV解组装速率常数k≈0.105 μM
-1 s
-1,胞质Hsc70约20–30 μM,提示Hsc70结合后少于半秒内解笼。为可靠性可能牺牲特异性:解包被机器可能弱招募至所有组装网格蛋白结构而非仅CCV;早期周转可能无直接生物学功能,仅为Hsc70/DnaJ活性泄漏。但阻止内吞位点网格蛋白交换对CCP形成有害,提示其直接调控内吞位点形成。
4 早期网格蛋白周转在CCP形成中的结构功能
4.1 网格蛋白动态调控膜形变
ATP耗竭停止网格蛋白交换并阻断CCP成熟和囊泡出芽;上皮和神经元细胞研究证实解包被机器在衣被成熟和囊泡形成中的关键作用。网格蛋白是最早招募蛋白之一,初始组装可为平面结构;酵母中先在平面膜组装,哺乳动物中组装与膜曲率逐渐增加相关。平面全六边形晶格适应膜形变需引入五边形开口,只能通过移除和/或重排triskelia实现;细胞内周转可能对应六边形向含五边形衣被转变。未覆盖成纤维细胞中低曲率网格蛋白阵列常见七边形与五边形并置,而高曲率衣被和闭合笼中七边形罕见,七边形可能代表中间状态。但网格蛋白动态是适应还是驱动膜形变仍不清楚:ATP耗竭阻断CCP成熟,而无细胞重建中抑制Hsc70/auxilin介导周转似不阻碍膜形变;酵母clathrin缺失仍形成内吞囊泡。保守性不一定意味着功能相同;哺乳动物膜形变起始仍有争议且可变,酵母膜形变高度刻板,发生在整个过程最后约10 s并主要依赖肌动蛋白聚合。酵母clathrin远早于肌动蛋白机器招募,必先在平面膜组装并经历平面-弯曲转变;但酵母内吞位点衣被结构从未被观察,动态行为可能只反映松散组装而非有序晶格。酵母数据较少,荧光损失后光漂白(FLIP)显示动态,SiMS显示快速周转;需进一步研究,早期解包被机器招募在酵母中从未观察。哺乳动物早期衣被非完全六边形,铂复型EM显示“不完美”晶格含断裂和缺失triskelia,可能预载五边形以促进曲率生成;空位可降低曲率生成能量成本。可想象解包被机器优先移除紧密结合的triskelia,维持部分松散结构以容纳曲率变化;此时周转不驱动膜形变而允许其发生。这可调和酵母和哺乳动物差异:酵母膜形变主要由肌动蛋白驱动,clathrin缺失不阻碍出芽;哺乳动物中肌动蛋白网络在高膜张力时关键,中等张力时网格蛋白动态维持松散衣被,促进形变起始,随后弯曲含五边形构型稳定新生曲率;无网格蛋白时不稳定膜形变导致出芽失败。微图案基底产生稳定曲率后,clathrin敲低仍可内吞支持此假说。也可能网格蛋白在酵母和哺乳动物中演化出不同功能,但多数同源内吞蛋白功能相似,因此更可能共享类似功能;Hsc70/DnaJ控制的组装可能调控内吞位点成熟,缺陷在哺乳动物导致出芽失败而在酵母不导致,仅因需对抗的力不同。
4.2 衣被结构校对
CCP寿命跨物种高度可变:拟南芥约30–40 s,酿酒酵母约1–3 min,哺乳动物约30–300 s。短寿命小窝被认为是流产性内吞事件,即新生衣被快速解组装而未形成囊泡。CCP随机成核并需稳定,否则快速解组装;稳定机制可能与货物捕获相关。表达缺失appendage结构域的AP-2复合物α-adaptin突变体扰动曲率生成,网格蛋白组装为平面晶格并转为流产性事件。AP-2 α亚基结合多种内吞辅助蛋白包括auxilin,也结合amphiphysin、Eps15、epsin和AP180/CALM,这些均参与膜形变:Eps15与FCHo1/2互作;FCHo1/2和amphiphysin含BAR结构域;epsin和AP180/CALM分别通过ENTH和ANTH结构域中的两亲螺旋楔入膜。Auxilin与这些曲率生成蛋白结合同一AP-2亚基,可能构成auxilin介导网格蛋白脱被与内吞蛋白招募相互调控并影响膜形变的机制,提示网格蛋白组装调控、辅助蛋白招募和膜弯曲间复杂互作超出单一蛋白结构力学属性。
5 早期网格蛋白周转的调控功能
5.1 网格蛋白动态与货物招募
5.1.1 网格蛋白周转与货物捕获的互作
内吞位点由结构化和高度柔性组分复杂平衡构成。Hsc70/DnaJ驱动的网格蛋白交换可防止过稳定组装,维持位点部分动态性,促进/调控蛋白扩散和招募尤其货物。无细胞重建中通过auxilin或Hsc70突变阻止CCP网格蛋白交换,完全消除转铁蛋白受体(TfR)聚集。货物捕获参与位点成熟:TfR过表达减少早期流产事件;μ-阿片神经肽受体泛素化缺失妨碍内吞成熟;酵母分泌途径抑制显著增加内吞事件寿命,提示货物招募作用保守。平面网格蛋白晶格也显示晶格重塑与货物选择互作:长期结构参与生长、黏附和迁移,但多个研究显示斑块内或邻近发生内化;斑块triskelia ATP依赖周转。Leyton-Puig等结合超分辨和活细胞TIRF显示LPA受体1等受体激活与肌动蛋白网络介导斑块解组装和CCV形成相关,提示平面斑块可作为CCV形成货物选择枢纽。未覆盖细胞EM常见平面晶格边缘七边形和五边形开口,可能代表弯曲中间态,强调动态、货物招募和膜形变紧密互作。但网格蛋白动态在货物招募中的作用可能间接:网格蛋白无已知货物结合区,多数adaptor直接结合货物。哺乳动物TfR由AP-2经Yxx?基序识别。多种adaptor在内吞位点动态:AP-2 FRAP快速交换;酵母Yap1801/2和AP-2亚基Apl1光漂白后部分恢复。Adaptor交换可能是货物捕获机制:游离adaptor周转,结合货物者更稳定;网格蛋白周转可能介导差异交换。哺乳动物中网格蛋白周转贯穿位点成熟,adaptor动态是否随时间变化仍不清楚。AP-2结合含YXXφ货物改变构象,影响网格蛋白招募和CCP成熟,提示网格蛋白-adaptor结合与货物-adaptor结合直接互作,可能与网格蛋白/adaptor动态相关。但网格蛋白和adaptor动态似 largely independent:ATP耗竭完全阻止网格蛋白交换但不影响AP-2动态;ATP耗竭时adaptor是否仍能捕获货物不清楚。这种独立性可能提示网格蛋白交换与货物招募间复杂互作依赖其他未鉴定因子。
5.1.2 蛋白组装调控:最佳网格蛋白:衔接蛋白比例
网格蛋白动态也可能调控内吞位点adaptor组装。网格蛋白:adaptor比例是内吞位点形成调控关键,多个研究显示其直接影响衣被刚度及膜形变起始。受控网格蛋白周转可作为调节adaptor组装和衣被硬化的机制,确保货物捕获足够时间;货物捕获也可促进衣被硬化,凸显这些组分复杂互作。
5.1.3 蛋白组装调控:限制货物拥挤
货物量在膜形变中的作用强调网格蛋白动态与货物选择互作的重要性:许多货物为跨膜蛋白,在两个膜小叶间强不对称;低密度脂蛋白(LDL)受体、整合素或免疫受体等具大胞外域, bulky胞外域对外小叶产生显著空间位阻压力,对抗膜形变、妨碍CCV出芽。货物分子空间位阻压力及其对膜形变直接影响已在COPII包被囊泡运输调控中显示。因此调控每个小窝货物数可能对促进膜弯曲关键,提示内吞位点货物数存在受限窗口;Hsc70/DnaJ机器控制网格蛋白动态可能参与调控货物招募以落入最佳窗口。
5.2 网格蛋白组装与脂质组成
质膜脂质组成在内吞位点起始和成熟中关键,脂质是膜可变形性的强驱动因素。磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸(PIP
2)在内吞位点内小叶高浓度,是CCP形成必需,是许多内吞蛋白主要结合脂质,如FCHo1/2、AP-2复合物以及含ENTH/ANTH结构域蛋白(epsin、AP180/Yap180)。AP-2复合物通过β2 appendage招募I型磷脂酰肌醇4-磷酸5-激酶γ(PIPKIγ)至内吞位点;β2 appendage也结合网格蛋白且对后者亲和力更高。因此选择性移除网格蛋白triskelia可能促进PIPKIγ招募及PIP
2富集。结合PIP
2也锚定AP-2并触发开放构象招募网格蛋白,提示选择性移除网格蛋白triskelia可能反而促进内吞位点进一步网格蛋白组装。多不饱和磷脂可适应膜曲率,降低dynamin和endophilin形变膜的能量成本;网格蛋白动态可能通过PIP
2富集间接促进膜形变,进一步凸显内吞位点蛋白组装调控复杂性。
5.3 网格蛋白组装与内吞蛋白空间组织
控制内吞蛋白组装不仅控制量也控制组织,可涉及高度刻板和保守空间模式。例如网格蛋白一般位于位点中心,许多蛋白包括肌动蛋白组装相关蛋白主要在网格蛋白衣被边缘组装(酵母和哺乳动物)。此精细结构说明网格蛋白核心作用:作为刚性支架蛋白,网格蛋白与许多内吞参与者互作并帮助驱动其定位模式。两项互补研究显示网格蛋白轻链与Hip1R和Sla2同源物互作参与定时和指导网格蛋白晶格边缘肌动蛋白聚合。因此通过解包被机器控制网格蛋白组装可能关键,其他蛋白可能依赖衣被大小形状正确招募。此外,许多参与囊泡出芽的蛋白在网格蛋白晶格边缘特定招募模式提示网格蛋白调控CCP整体大小。最强证据在酿酒酵母:野生型内吞囊泡大小受严格控制;clathrin缺失细胞仍形成内吞囊泡但数量减少,平均大小正常但大小变异大增。其他生物有保守线索:果蝇AP180同源物LAP突变损害突触前bouton网格蛋白定位,导致囊泡数量减少和大小变异增加;哺乳动物AP-180调控网格蛋白篮大小。哺乳动物内吞中网格蛋白衣被组装时间随货物大小缩放;病毒颗粒等大物体与显著更长网格蛋白组装时间和延迟内化相关,表明网格蛋白组装可调节以适应货物大小。这强调动态控制网格蛋白组装以确保内吞过程对货物招募时间和货物大小等线索的响应性和适应性。
6 展望
网格蛋白组装机制及其对CCP形成调控意义是内吞领域长期问题。网格蛋白自组装及与众多内吞伙伴互作的结构属性已详细阐明,但这些属性如何动态控制内吞机器组装仍大多未知。早期假说认为网格蛋白交换纯结构性,塑造内吞小窝并驱动膜形变;活细胞成像和遗传操作揭示网格蛋白动态与内吞过程成熟明确联系。但网格蛋白周转在调控网络中的位置仍未解决。主要障碍是不同条件实验常产生分歧结果。综述审视网格蛋白动态多种角色和互作,许多似乎在内吞不同时间点作用;提示网格蛋白周转可能对多个下游组分有影响,各自以特定方式贡献成熟,而非简单一因一效,可能在复杂互连调控矩阵中运作。另一障碍是蛋白多重性:网格蛋白也参与反式高尔基网络运输等;解包被机器也从高尔基来源CCV解包被。因此通过操纵Hsc70/DnaJ与网格蛋白互作特异性解析内吞位点功能具挑战。内吞位点形成中部分脱被与出芽后完全解组装对比,可能提示Hsc70/DnaJ机器对曲率较低网格蛋白结构活性和/或亲和力较弱。生成对网格蛋白亲和力较弱的Hsc70/DnaJ突变体可能消除早期周转而不妨碍最终脱被,作为研究早期交换特异性功能的策略。另一个未答问题是网格蛋白动态在内吞事件间或位点成熟寿命中潜在变异性;FRAP假设稳态,不能轻易区分蛋白招募和交换;SMIT技术可帮助但有限制。网格蛋白动态变异性可能存在,因为内吞事件本身可变且机器经历许多变化。人轻链亚型CLCb磷酸化状态直接影响位点成熟:未磷酸化CLCb增加早期事件终止;这些流产事件也招募DnaJ蛋白GAK,提示网格蛋白磷酸化状态与解包被机器互作,可能直接影响周转。Maib等显示未磷酸化CLCb相关流产事件未能聚集货物,提示网格蛋白动态可能不只有一个角色而是贡献多种调控过程以确保CCP形成。理解网格蛋白周转确切功能需仔细考虑CCP形成全过程内吞网络广泛动态图景;系统解析蛋白动态并整合到内吞位点调控网络可能有助于阐明内吞过程及动态多蛋白组装基本原则。