基于RNA-seq的肾细胞癌单样本分子分型工具IRIS-RCC

《npj Precision Oncology》：An individual sample predictive model to classify patients with metastatic renal cell carcinoma

　　

摘要

利用 IMmotion 151 临床试验（IM151）的 RNA-seq 数据，已定义了 7 个肾细胞癌（RCC）生物聚类。已有多个研究组尝试在 RCC 数据集上预测聚类，但未纳入 IM151 中治疗反应关联的观察。我们开发了 IRIS-RCC（肾细胞癌个体 RNA-seq 内在分型；访问地址为 https://irisrcc.vindhy-datascience.com/），旨在利用单一样本模型预测分子聚类。IRIS-RCC 通过使用比率基因表达值，在给定样本内对基因表达进行标准化。