综述：慢性鼻窦炎的空间转录组学研究：从机制发现到临床转化的进展与挑战

《International Journal of Molecular Sciences》：Spatial Transcriptomics in Chronic Rhinosinusitis: Deciphering Tissue Architecture, Immune Niches, and Precision Therapeutics

**摘要**慢性鼻窦炎（CRS）是一种异质性疾病，其中上皮损伤、免疫激活和基质重塑以局部组织微环境的形式组织分布。 Bulk RNA测序和单细胞RNA测序已确定了重要的细胞状态，但解离过程会去除解剖学关系，而这些关系对于确定这些状态在何处共存至关重要。空间转录组学（ST）通过将RNA映射到完整的鼻窦组织上来弥补这一空白，部分平台还能映射蛋白质。本综述以单一的转化链条为框架，对证据进行分级综合，该链条为：空间微环境→分子特征→可能的生物学机制→CRS表型/内型→临床意义→治疗相关性→验证状态。直接的CRS ST证据与单细胞RNA测序支持、计算预测、蛋白质或原位证据、实验扰动、临床验证以及其他炎症疾病的推断结果相区分。目前的CRS研究支持嗜酸性粒细胞丰富的上皮病变的空间分室化、ALOX15阳性巨噬细胞程序、GZMK阳性CD8 T细胞-成纤维细胞邻近区域以及治疗相关的上皮和基质变化。然而，大多数配体-受体相互作用仍属预测性推断，仅凭空间关联无法确立功能因果关系。因此，ST最好被视为一项发现和机制优先排序技术，其临床前景——生物标志物筛选、生物制剂匹配和应答监测——需要独立队列、锁定检测、患者水平可重复性以及前瞻性结局研究。我们比较了研究设计和平台，讨论了包括空间自相关和假重复在内的统计学问题，并提出了一种谨慎的转化框架，通过正交验证和临床验证将空间观察转化为可操作证据。