整合多组学收敛评分框架揭示肌肉减少症中线粒体与收缩通路的系统性关联
《International Journal of Molecular Sciences》:Integrated Multi-Omics Convergence Scoring Reveals Modular Network Architecture with Age-Associated Mitochondrial Signatures in Sarcopenia
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时间:2026年10月25日
来源:International Journal of Molecular Sciences 5.6
摘要
肌肉减少症源于遗传、表观遗传、转录组、代谢和微生物组相关扰动的汇聚,然而传统的多组学分析往往产生碎片化、层级特定的特征列表。我们开发了一个整合的多组学收敛评分框架,通过结合标准化层级统计证据、层级特定通路背景、网络特征和肌肉减少症特定的疾病相关性证据,计算出整合收敛评分(ICS)。我们将其应用于五个独立队列(208 名参与者)的骨骼肌转录组、与衰老相关的肌肉 DNA 甲基化以及肌肉质量和力量的全基因组关联研究,每种数据均针对其自身的零分布进行分析。基因水平的变化较少且无法重复,而在合并分析中,肌肉减少症组的线粒体呼吸、线粒体翻译和收缩通路评分较低。这些线粒体特征在与衰老、衰弱和肌少症前期相关的比较中也较低,表明存在与肌肉衰老共有的成分。这三个层级涉及很大程度上不同的机制。与基于排名的合并统计相比,ICS 排名靠前的基因形成了连接更紧密的网络,这在一定程度上反映了评分中的网络成分。背景图谱将这些模块置于线粒体呼吸、基于肌酸的能量缓冲和 NAD–PGC-1α 信号传导之中。该框架将碎片化的多组学证据组织成与肌肉减少症相关的系统水平基因网络,并为未来的功能研究优先确定候选基因和机制。
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