摘要
裂褶菌（Pappia fissilis）是一种白腐真菌，能够定殖木质纤维素底物并降解植物细胞壁成分，可能参与森林生态系统中木质碎屑的分解和碳循环。从其子实体中已分离出多种羊毛脂烷型三萜类化合物及其他生物活性化合物，提示其在天然产物开发方面具有潜在价值。然而，此前对该物种的研究主要集中在分类学、线粒体基因组学以及子实体的化学谱分析上，对其基因组特征以及木材腐朽和次级代谢的遗传基础认识甚少。本研究采用结合PacBio HiFi、Illumina和Hi-C数据的混合测序策略，生成了裂褶菌（P. fissilis）的染色体水平基因组组装及注释，并进行了全面的系统基因组学、比较基因组学、CYP450、CAZyme及生物合成基因簇（BGC）分析，报道了该物种的首个基因组资源。组装的基因组跨度为38.63 Mb，其中97.52%的序列锚定到11条染色体上，BUSCO完整度为95.4%，预测有9499个蛋白质编码基因。系统基因组学分析表明，裂褶菌（P. fissilis）与包含Phlebia radiata和P. brevispora的类群互为姊妹群，估计分化时间约为5317万年前。该基因组包含153个CYP450基因、436个CAZyme基因以及26个候选BGC，共含有30个核心生物合成基因（22个萜类、5个T1PKS、1个T3PKS、2个β-内酯），这些核心基因主要与萜类生物合成相关，同时也涵盖多种类型的多聚酮合酶（PKS）基因以及参与β-内酯生物合成的基因。综上所述，这些结果为研究裂褶菌（P. fissilis）的基因组进化、木材腐朽生态学及次级代谢潜力建立了染色体水平参考，并为未来候选生物合成基因及其相关天然产物的功能表征奠定了基础。
