摘要
背景：赖氨酸巴豆酰化（Kcr）是一种具有代谢响应性的修饰，但在卵巢癌中与巴豆酰化相关的转录组所涉及的细胞生态系统尚未得到完整表征。方法：整合三个卵巢癌单细胞队列，定义了巴豆酰化相关转录评分（CRTS）。我们分析了细胞组成、恶性细胞程序，推断了配体-受体通讯，并在大宗队列中评估了一种12基因生存相关性读出指标。采用空间转录组学、SHAP、癌症依赖性图谱和虚拟基因敲除进行探索性三角验证。结果：与低CRTS细胞相比，高CRTS细胞中成纤维细胞和恶性细胞的比例相对较高，而CD8+ T细胞比例较低。在恶性细胞中，上皮-间质转化（EMT）、侵袭和转移模块评分均较高（所有名义细胞水平 p < 0.0001），且CRTS与侵袭（rho = 0.269）和转移（rho = 0.252）呈正相关。CellChat推断高CRTS组有1915个相互作用，低CRTS组为519个，其中高CRTS组的细胞外基质（ECM）相关信息流更为强烈。一个12基因模型在评估的患者队列中实现了生存分层，并与较高的预测免疫排斥相关。WTAP、SIRT2和ALDH5A1通过模型解释和计算机模拟扰动被优先识别。九个模型基因在其中一个空间切片中与推断的成纤维细胞丰度相关（rho约0.37–0.62；名义斑点水平 p < 0.05）。结论：CRTS标记了一种成纤维细胞富集、ECM活跃的卵巢癌转录生态系统，与侵袭性恶性细胞程序及预测免疫排斥相关。研究结果支持可检验的假设，但尚未建立直接的Kcr修饰、患者水平生态系统重塑或分子因果关系。
