地榆线粒体基因组的测序、组装与特征分析

《BMC Genomics》：Structural characteristics and phylogenetic analysis of the complete mitochondrial genome of Sanguisorba officinalis (Rosaceae)

**摘要****背景**地榆（*Sanguisorba officinalis*）是一种蔷薇科野生牧草，广泛分布于中国各地，具有质地柔嫩、叶片无毛、无异味等特点。该物种作为食材、传统中药以及观赏植物均备受推崇。然而，目前对地榆基因组的研究，尤其是其线粒体基因组的探索仍然有限。**结果**本研究对地榆的线粒体基因组进行了测序与组装，鉴定出一个长度为295,903 bp的单主环分子。在成功注释的60个基因中，包括33个蛋白编码基因、24个转运RNA基因和3个核糖体RNA基因。其中，*atp8*基因在6个蔷薇科物种中表现出较高的核苷酸多态性。在地榆的线粒体基因组中，我们检测到76个简单序列重复（SSRs）、50个散布重复序列和15个串联重复序列。值得注意的是，在32个不同的蛋白编码基因（PCGs）中检测到460个RNA编辑位点，所有编辑位点均涉及胞嘧啶（C）向尿嘧啶（U）的转换，同时确定有68个来源于叶绿体的DNA片段从叶绿体基因组转移到了线粒体基因组。最后，利用29个蔷薇科物种和2个外类群物种的线粒体基因组数据构建了系统发育树，以验证蔷薇科内部的进化关系。**结论**本研究为地榆的遗传背景提供了新的见解，同时也为蔷薇科种质资源的探索与开发利用提供了有价值的参考。