基于表型性状、简单重复序列间(ISSR)和逆转录转座子间(IRAP)标记的伊朗哈马丹省美花翠雀(*Delphinium consolida*)关联分析与遗传变异研究

《Genetic Resources and Crop Evolution》:Association analysis and genetic variation of Delphinium consolida in Hamedan Province, Iran revealed by phenotypic traits, inter-simple sequence repeat (ISSR) and inter-retrotransposon (IRAP) markers

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年10月26日 来源:Genetic Resources and Crop Evolution 1.9

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   摘要飞燕草(*Delphinium consolida* L.)是一种具有显著观赏价值和药用价值的草本植物。本研究采用21个间隔简单重复序列(ISSR)和间隔转座子扩增多态性(IRAP)引物及其组合,对40份*D. consolida*种质资源的遗传多样性进行了评估。共扩增出

  

摘要

飞燕草(*Delphinium consolida* L.)是一种具有显著观赏价值和药用价值的草本植物。本研究采用21个间隔简单重复序列(ISSR)和间隔转座子扩增多态性(IRAP)引物及其组合,对40份*D. consolida*种质资源的遗传多样性进行了评估。共扩增出148个位点,其中138个(93.24%)表现为多态性。通过Jaccard系数计算的遗传相似度显示存在广泛变异,非加权组内算术平均法(UPGMA)聚类分析将种质资源划分为三个不同的遗传群。在各类分子标记体系中,UBC873、UBC834及TOS2被鉴定为信息量最高的标记工具,其多态性信息含量(PIC)、有效多态比率(EMR)和标记指数(MI)均最高。平均PIC为0.3183,其中UBC873(0.3914)和UBC834(0.3889)最高。此外,Nei基因多样性的平均值为0.4614,Shannon信息指数的平均值为0.6678,其中UBC834表现出最高的多样性估计值(\(H=0.5723, I=0.8257\))。为探讨基因组特征与表型表达之间的关系,分析了六种形态性状。Mantel检验表明遗传距离矩阵与表型距离矩阵之间的相关性不显著(\(r=0.114\),\(P=0.2575\)),比较矩阵分析和热图分析也支持了这一发现。然而,前向逐步多元线性回归分析鉴定出一组六个分子标记,它们共同解释了株高表型方差的54.1%(\({R}^{2}=0.541, P<0.001\))。这些结果表明,尽管中性基因组变异并不严格反映形态特征,但特定的标记-性状关联对于株型性状仍具有很高的信息价值,为*D. consolida*育种计划中的基因型鉴定和种质保存提供了框架。

图文摘要

飞燕草(*Delphinium consolida* L.)是一种具有显著观赏价值和药用价值的草本植物。本研究采用21个间隔简单重复序列(ISSR)和间隔转座子扩增多态性(IRAP)引物及其组合,对40份*D. consolida*种质资源的遗传多样性进行 了评估。共扩增出148个位点,其中138个(93.24%)表现为多态性。通过Jaccard系数计算的遗传相似度显示存在广泛变异,非加权组内算术平均法(UPGMA)聚类分析将种质资源划分为三个不同的遗传群。在各类分子标记体系中,UBC873、UBC834及TOS2被鉴定为信息量最高的标记工具,其多态性信息含量(PIC)、有效多态比率(EMR)和标记指数(MI)均最高。平均PIC为0.3183,其中UBC873(0.3914)和UBC834(0.3889)最高。此外,Nei基因多样性的平均值为0.4614,Shannon信息指数的平均值为0.6678,其中UBC834表现出最高的多样性估计值(\(H=0.5723, I=0.8257\))。为探讨基因组特征与表型表达之间的关系,分析了六种形态性状。Mantel检验表明遗传距离矩阵与表型距离矩阵之间的相关性不显著(\(r=0.114\),\(P=0.2575\)),比较矩阵分析和热图分析也支持了这一发现。然而,前向逐步多元线性回归分析鉴定出一组六个分子标记,它们共同解释了株高表型方差的54.1%(\({R}^{2}=0.541, P<0.001\))。这些结果表明,尽管中性基因组变异并不严格反映形态特征,但特定的标记-性状关联对于株型性状仍具有很高的信息价值,为*D. consolida*育种计划中的基因型鉴定和种质保存提供了框架。

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