2014—2025年泰国包涵体肝炎相关禽腺病毒的遗传多样性

《Research in Veterinary Science》：Genetic diversity of inclusion body hepatitis-associated fowl adenoviruses in Thailand from 2014 to 2025

　　

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  在2014–2025年泰国IBH相关禽腺病毒（FAdV）中鉴定出FAdV-8b、FAdV-11和FAdV-2。
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  观察到时间推移变化，FAdV-8b于2019年首次被检出，此后成为优势型别。
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  FAdV-2仅在2018年之前被检出，而FAdV-11在多个年份中持续存在。
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  基于部分hexon L1-loop序列，泰国FAdV-8b分离株被划分为三个系统发育群。
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  群别相关的氨基酸替换主要位于Hexon L1-loop的高变区。

引言

禽腺病毒（FAdVs）是无包膜病毒，属于腺病毒科（Adenoviridae）禽腺病毒属（Aviadenovirus）。其基因组为线性双链DNA，大小约43–46 kb，编码10种结构蛋白和11种非结构蛋白（Benk?等，2022）。在主要衣壳蛋白中，Hexon、Fiber和Penton基座对于病毒结构、宿主相互作用、免疫识别和抗原变异具有重要作用。Hexon蛋白的环1（L1）区域包含血清型特异性抗原位点，由于基于序列的聚类结果通常与常规血清分型结果一致，因此该区域被广泛用于分子分类（Schachner等，2016）。此外，L1区域包含四个高变区（HVRs），这些区域是已知的抗体结合位点。HVRs的变异可能改变同一血清型内病毒的抗原性（Adel等，2021；Niczyporuk，2018）。相比之下，Fiber蛋白是组织嗜性、型特异性中和反应和致病性的重要决定因素，而相对保守的Penton基座在血清型鉴定中的价值有限（De Luca等，2023；Marek等，2010；Schachner等，2022；Schachner等，2019；Sohaimi和Hair-Bejo，2021）。

根据基因组限制性片段长度多态性，FAdVs被分为五个种（FAdV-A至FAdV-E）；根据血清交叉中和试验，被分为12个血清型（FAdV-1至FAdV-7、FAdV-8a、FAdV-8b及FAdV-9至FAdV-11）（Hess，2000）。这些病毒与鸡的多种重要疾病相关，包括包涵体肝炎（IBH）、肝炎心包积液综合征（HHS）和腺病毒砂囊侵蚀（AGE）（Abdellatif等，2025；Eneku等，2025；Mohamed等，2018；Stoute等，2025）。在这些疾病中，IBH是一种具有重要经济意义的疾病，尤其是对于肉鸡而言，因为疫情暴发可导致死亡率升高、生长性能下降、易感继发感染，并造成大量生产损失（Kiss等，2021）。IBH最常见于FAdV D种，包括血清型2、3、9和11，以及E种，包括血清型6、7、8a和8b；然而，优势血清型在地理和时间上存在差异（Abdellatif等，2025；Chitradevi等，2021；Eneku等，2025；Kim等，2025；Mohamed等，2018；Ojki?等，2026；Schachner等，2021；Schachner等，2018；Stoute等，2025；Tamam等，2025）。

循环FAdVs的血清型和遗传组成在流行病学上具有重要意义，因为与IBH相关的病毒可能随时间发生变化。不同血清型和遗传变异体可能在同一地理区域内共同传播，且优势血清型可能随时间推移而改变。这与疾病的预防和控制尤为相关，因为异源FAdV血清型之间的保护力通常有限，基于某一特定血清型的疫苗可能无法对抗原性不同的田间毒株提供完全保护（De Luca等，2020；Islam等，2026；Schachner等，2018）。FAdV群体可能通过突变和重组产生分化，形成新的遗传变异体。因此，持续的分子监测对于鉴定循环血清型和遗传谱系以及支持基于证据的疾病控制策略至关重要（Schachner等，2019；Schachner等，2021）。

在泰国，此前已在IBH感染鸡中鉴定出FAdV-2，近期研究也表征了与泰国IBH鸡相关的FAdV-8b（Junnu等，2014；Pohuang等，2025）。然而，早期和近期诊断样本中IBH相关FAdV型别的时间分布特征仍缺乏系统表征。特别是，需要回顾性数据来确定FAdV-8b在近期报告之前是否已经存在，记录其他IBH相关型别随时间的检出情况，以及表征多个采样年份间同型别的序列多样性。这些信息将为后续监测结果的解读提供历史基线，并为鉴定具有代表性的田间毒株以进行进一步的诊断和抗原性评价提供依据。

因此，本研究旨在利用部分hexon L1-loop测序，表征2014至2025年间泰国鸡诊断样本中检出的IBH相关FAdVs的时间分布和遗传多样性。通过检测分子血清型组成、系统发育关系和推定氨基酸替换模式，为未来监测、诊断解读以及疫苗毒株相关性的评价提供支持。

各部分摘要

样本采集与病例筛选

最终序列数据集包含56份与IBH或疑似IBH相关的FAdV阳性鸡样本，采集时间为2014至2025年，来自两组样本。第一组为2014至2021年间提交至甘彭塞安兽用诊断中心（KVDC）的IBH阳性病例存档DNA提取物，储存温度为?20 °C。第二组为2022至2025年间提交的鸡肝脏组织，本回顾性分子研究对这些组织中与IBH相关的FAdV进行了表征……

IBH相关FAdVs的检测与测序

从2014至2025年间采集的与IBH或疑似IBH相关的FAdV阳性鸡样本中，成功扩增出约721 bp的部分hexon L1-loop片段。56个PCR扩增产物获得了质量足以进行一致性组装、血清型判定、系统发育分析和推定氨基酸序列比较的双向Sanger测序。最终数据集包含2014年间诊断样本中获得的56条FAdV序列……

讨论

hexon L1-loop区域的序列分析已被广泛用于禽腺病毒（FAdVs）的分子分型和系统发育分类，因为该区域包含与血清型相关的决定因素，且通常提供与常规血清分型一致的聚类模式（Chitradevi等，2021；Gawe?等，2016；Marek等，2010）。在本研究中，部分hexon L1-loop测序足以对IBH相关FAdV阳性诊断样本进行判定……

结论

本回顾性研究表征了2014–2025年间泰国IBH相关诊断样本中检出FAdVs的部分hexon L1-loop序列。基于序列的分型在56条分析的序列中鉴定出FAdV-2、FAdV-8b和FAdV-11。FAdV-8b在该数据集中首次于2019年被检出，占2019–2025年间35条序列中的30条。FAdV-11在多个年份中被检出，而FAdV-2在2017年之后未被检出。

伦理与许可

本研究已获泰国康开拉克赛农帕大学机构实验室动物护理与使用委员会批准（许可编号：ACKU66-VET-021，2023年4月7日）。

CRediT作者贡献声明

Ploypassorn Homklinkaew：撰写——初稿，形式分析，数据整理。Sittinee Kulprasertsri：撰写——初稿，资源，调查研究。Sakuna Phatthanakunanan：方法学。Kanyakodchanan Woramahatthanon：方法学。Kriangkrai Witoonsatian：资源。Pun Panomwan：资源。Thaweesak Songserm：资源。Preeda Lertwatcharasarakul：撰写——审阅与编辑，指导，项目管理。

资助

本研究由康开拉克赛农帕大学兽医学院资助（编号：67/28）。

利益冲突声明

作者声明不存在可能影响本文所报告工作的已知竞争性经济利益或个人关系。

Ploypassorn Homklinkaew|Sittinee Kulprasertsri|Sakuna Phatthanakunanan|Kanyakodchanan Woramahatthanon|Kriangkrai Witoonsatian|Pun Panomwan|Thaweesak Songserm|Preeda Lertwatcharasarakul