《Microbiological Research》:Psl exopolysaccharide regulates biofilm formation and environmental adaptation in
Pseudomonas fluorescens PF07
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•PF07携带三个EPS生物合成基因簇,包括psl、alg和pga。•Psl是PF07生物被膜基质最主要的结构决定因子。•Psl在生物被膜对环境胁迫的耐受性中起主导作用。•转录组学揭示了Psl缺乏后生物体的胁迫适应和代谢重塑。引言在假单胞菌属中,生物被膜的形成主要由胞外聚合物
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PF07携带三个EPS生物合成基因簇,包括psl、alg和pga。
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Psl是PF07生物被膜基质最主要的结构决定因子。
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Psl在生物被膜对环境胁迫的耐受性中起主导作用。
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转录组学揭示了Psl缺乏后生物体的胁迫适应和代谢重塑。
引言
在假单胞菌属中,生物被膜的形成主要由胞外聚合物(EPS)的产生驱动,包括多糖、蛋白质和胞外DNA等,其中多糖在塑造生物被膜结构和增强细胞韧性方面起着核心作用(Hwang等,2012)。在铜绿假单胞菌中,三种主要的外聚多糖——藻酸盐、Pel和Psl——已被广泛研究,并显示出在生物被膜发育过程中具有不同但部分重叠的功能,涵盖从初始附着到结构稳定和胁迫保护等多个阶段(Rahman等,2021)。此外,外聚多糖已被证明与环境胁迫下耐受性增强有关,包括消毒剂。EPS作为一种水合屏障,限制了有害物质的扩散,从而增强了细菌对低温、氧化胁迫、渗透胁迫和抗菌剂的耐受性(Flemming和Wingender,2001;Fulaz等,2019)。除结构功能外,不同的外聚多糖在不同环境条件下还表现出独特的保护作用。铜绿假单胞菌能产生多种外聚多糖,主要为Psl、Pel和藻酸盐,它们共同构成生物被膜基质,并在表面附着、结构发育和胁迫保护中表现出不同的、依赖于环境背景的功能。Psl促进细胞聚集并增强生物被膜稳定性,而Pel与对剪切力和氧化胁迫的耐受性相关。藻酸盐凭借其强大的保水能力,支持细菌在营养匮乏和低温条件下的存活。此外,EPS还能结合金属离子、营养物质和信号分子,并与胞外DNA和蛋白质相互作用,共同为生物被膜的结构稳定性和环境适应性做出贡献。尽管从铜绿假单胞菌中已积累了大量相关知识(Boyd和Chakrabarty,1995b;Colvin等,2012),但腐败相关假单胞菌中同源多糖的分布、调控和功能仍缺乏系统表征。
嗜冷细菌是导致冷藏食品腐败的主要因素,造成了巨大的经济损失和产品保质期的缩短(Wickramasinghe等,2019)。其中,荧光假单胞菌因其卓越的新陈代谢多样性和环境适应性,已成为主要的嗜冷腐败菌之一(Boulares等,2011;Shabana等,2022;Zhang等,2025)。作为嗜冷菌,该菌能在低温条件下增殖并形成生物被膜,使其能在食品冷链中占据微生物群落的优势地位。由于保护性生物被膜基质的作用,荧光假单胞菌表现出对氧化胁迫、渗透胁迫和化学胁迫的强耐受性,包括对常用消毒剂如次氯酸钠的暴露耐受(Liu等,2023)。值得注意的是,这种耐受性在很大程度上归因于其形成生物被膜和产生EPS的能力,二者共同保护内嵌细胞免受环境危害。
尽管已有多种外聚多糖被证实参与假单胞菌生物被膜的形成,但在与环境相关的胁迫条件下,它们在腐败相关假单胞菌中的相对功能贡献尚未得到系统评估。在本研究中,我们构建了靶向删除突变株,破坏了荧光假单胞菌PF07中三种多糖生物合成途径,并全面评估了它们在生物被膜形成、基质组成以及对食品加工环境中相关胁迫(包括离子胁迫、低温和消毒剂处理)耐受性中的作用。我们的结果表明,Psl是PF07中起关键结构和功能作用的多糖,对生物被膜稳定性和胁迫耐受性贡献显著。这些发现揭示了生物被膜多糖之间存在明确的功能层级,并表明Psl在PF07冷链条件下的适应性生物被膜策略中发挥核心作用。
章节摘要
菌株与培养条件
荧光假单胞菌PF07(BioProject登录号PRJNA800221;SRA登录号SRR17731482),系本实验室从大黄鱼(大黄鱼)中分离获得,在本研究中作为野生型(WT)菌株使用。选取了三个外聚多糖基因alg8、pslB和pgaC分别作为藻酸盐、Psl和PNAG的关键生物合成基因代表。alg8编码参与藻酸盐聚合的蛋白质,pslB编码一种糖基转移酶,
外聚多糖生物合成基因簇的遗传结构与生物被膜贡献
基于我们的基因组分析,在荧光假单胞菌PF07中鉴定出三个外聚多糖生物合成基因簇,分别负责Psl多糖、藻酸盐和PNAG的产生。如图1A所示,Psl生物合成基因簇由pslA–K组成。藻酸盐生物合成基因簇包含algA、algF、algJ、algI、algL、algX、algG、algE、algK、alg44、alg8和algD。PNAG生物合成基因簇包含pgaA–D。为探究其功能作用
讨论
生物被膜形成是一个高度协调的发育过程,细菌细胞在此期间从浮游生活方式转变为嵌入EPS基质中的结构化群落(O'Toole等,2000)。除结构组装外,EPS还作为一种多功能基质组分,主导着机械稳定性和环境韧性(Flemming和Wingender,2010)。我们的基因组分析揭示,荧光假单胞菌PF07具备合成三种
结论
在本研究中,我们系统解析了三种主要外聚多糖——Psl、藻酸盐和PNAG——在荧光假单胞菌PF07生物被膜形成和环境胁迫耐受性中的作用。结果表明,Psl合成的破坏显著损害了生物被膜的形成以及健壮胞外基质的构建,在离子胁迫和低温条件下尤为明显,而藻酸盐或PNAG的缺失则影响相对较小。此外,Psl的缺失显著地
资金声明
本研究得到浙江省自然科学基金(LZ23C200002)的资助。
作者贡献声明
Zhong Lu:撰写——初稿,验证,软件,方法论,形式分析,数据整理,概念构思。Junli Zhu:撰写——审阅与编辑,指导,资源,获取研究资金。Zhulin Zhou:撰写——审阅与编辑,软件,方法论。Lifang Feng:撰写——审阅与编辑。
Zhong Lu|Zhulin Zhou|Lifang Feng|Junli Zhu