系统毒理学与多组学方法确定了口腔鳞状细胞癌中与MTBC相关的计算特征

《Functional & Integrative Genomics》：Systems toxicology and multi-omics prioritize an MTBC-related computational signature in oral squamous cell carcinoma

**摘要**计算优先排序可以从复杂暴露中提名候选成分，但它并不能确立暴露或因果关系。我们将槟榔成分库与已存档的ADMET预测数据及口腔鳞状细胞癌（OSCC）转录组数据相结合，评估2-甲基-1,2,3,4-四氢-β-碳啉（MTBC）作为进一步研究候选物的价值。将GTEx唾液对照替换为44例TCGA-HNSC邻近正常组织后，OSCC裁判基因集从2,108个基因缩减至773个，并产生了一个包含11个基因的MTBC相关计算特征谱。在批量数据中，该特征谱的肿瘤鉴别能力并不优于表达量匹配后的随机裁判基因集。患者水平的单细胞分析并不支持先前报道的与上皮状态的阳性关联，而跨组织皮肤鳞状细胞癌分析显示与三级淋巴结构（TLS）评分存在空间一致性，但未能验证口腔或槟榔特异性效应。一个防泄漏的惩罚分类器在内部评估中将51例口腔肿瘤与44例邻近正常组织区分开（开发内嵌交叉验证AUC 0.964，95%CI 0.916–0.997），但不做出外部或筛查方面的声明。这些结果定义了一个可重复的计算优先排序框架和一个探索性的MTBC相关表达特征谱，该特征谱需要直接暴露测量和实验验证。**图形摘要**[图片：图形摘要，展示MTBC相关计算特征谱的研究框架与主要结果]