优化CRISPR-Cas9电穿孔核糖核蛋白方案实现心肌及骨骼肌细胞的高效基因敲除

《Methods》:A DNA-free CRISPR-Cas9 ribonucleoprotein electroporation protocol for efficient knockout generation in cardiac and skeletal muscle cell lines

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年10月27日 来源:Methods 3.6

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   摘要背景在心肌细胞相关细胞模型中进行高效、可重复的基因敲除对于心血管研究至关重要,但由于细胞类型对基因组编辑流程具有特异性敏感性,这仍然具有挑战性。方法我们开发了一种优化的 CRISPR-Cas9 基因组编辑方案,通过电穿孔核糖核蛋白(RNP)复合物来生成心脏和骨骼肌细胞的敲

摘要

背景

在心肌细胞相关细胞模型中进行高效、可重复的基因敲除对于心血管研究至关重要,但由于细胞类型对基因组编辑流程具有特异性敏感性,这仍然具有挑战性。

方法

我们开发了一种优化的 CRISPR-Cas9 基因组编辑方案,通过电穿孔核糖核蛋白(RNP)复合物来生成心脏和骨骼肌细胞的敲除系。我们还提供了关于 gRNA 设计、基因分型和克隆系生成的实用指导。利用人类 AC16 类心肌细胞和啮齿动物肌肉衍生细胞系(C2C12、L6 和 H9C2),我们优化了电穿孔条件,以在保证细胞活性的同时最大化编辑效率。

结果

靶向脂质运输调节因子 SAR1B/Sar1b 的 SpCas9-单引导 RNA(sgRNA)RNP 在所有模型中产生了高频移码插入/缺失突变,并显著降低了目标蛋白的表达。结合编辑效率和细胞存活率的复合敲除评分确定了最佳电穿孔设置:AC16 细胞为 1400 伏,10 毫秒,3 个脉冲;C2C12、L6 和 H9C2 细胞为 1500 伏,10 毫秒,3 个脉冲。

结论

该方案结合了合理的 sgRNA 设计、用于高效 RNP 组装的化学修饰 sgRNA 以及标准化基因分型,以提高可重复性。该框架可迁移至其他心肌细胞和肌肉衍生细胞类型,并支持多克隆和单克隆 CRISPR-Cas9 敲除方法。
Babak Nami|Yuhe Xiao|Gurpreet Kaur|Harish Babu Kolla|Ethan Finnigan|Aparna Vivek|Anu Jose|Simran Kumari|Petra C. Kienesberger|Thomas Pulinilkunnil

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