摘要
理解早期心脏发育异常需要将组织表型与分化过程中产生的细胞群体联系起来。我们建立了一个源自人诱导多能干细胞 (hiPSCs) 的心脏类器官平台，并结合表型检测、时间过程和第 9 天单细胞转录组学以及 CUT&Tag 技术来研究发育扰动。类器官包含多个细胞群体，并表现出阶段依赖性心脏转录程序。沙利度胺暴露改变了形态并减少了 TNNT2 阳性组织区域，在 0.01 μg/mL 浓度下钙瞬变幅度降低。在 10 μg/mL 浓度下进行的 RNA 测序发现心脏和神经嵴衍生物表达 1 (HAND1) 下调，从而促使进行了单独的遗传学调查。在使用一个已表征的 HAND1 敲除克隆进行的三组配对分化实验中，心肌细胞比例降低伴随着中胚层/间充质样细胞的相对富集。选定的心脏相关表达异常在第 15 天持续存在。表达和染色质占据分析确定了候选调控关联，位点特异性定量 PCR 支持 HAND1 占据选定的心脏相关区域。需要独立的遗传和功能验证来测试因果关系。总之，这些发现将 HAND1 缺失相关的组织异常置于其细胞背景中，并确定了候选占据区域，用于在人类三维模型中研究早期心脏分化。
