摘要
乳腺癌（BC）是一个严重的全球健康问题，其发病率和死亡率都在持续上升，而现有的治疗方法常常伴随着严重的副作用和药物耐药性。因此，需要具有更强疗效和更低副作用的新治疗药物。我们之前的研究报道了Monacolin X（一种来自海洋海绵相关真菌的次级代谢产物）的抗血管生成作用，该研究结合了体外实验、离体实验（包括DMBA诱导的乳腺癌大鼠模型）和计算机模拟（in silico）方法，确定了VEGFR2是其主要作用靶点。在本研究中，我们使用Schr?dinger Glide XP软件进行了分子对接和分子动力学（MD）模拟，以探究Monacolin X与关键抗血管生成靶点（包括IGFR、EGFR、NEFP1（NRP1）、Tie-2、VEGFR1/2和PDGFRα）之间的相互作用。作为对比，我们还使用了一些选择性抑制剂。对接分析显示，Monacolin X与IGFR（G-score = ?9.05）、PDGFRα（?7.57）、VEGFR1（?7.42）、Tie-2（?7.40）、VEGFR2（?7.515）、EGFR（?6.80）和NRP1（?5.15）之间的结合亲和力显著，其中氢键、疏水作用和静电相互作用促进了复合物的稳定性。值得注意的是，Monacolin X与IGFR和Tie-2之间表现出强烈的相互作用，这提示其可能具有抑制血管生成信号传导的潜力。分子动力学模拟在300 K和1 bar的压力下进行了50纳秒的模拟；通过RMSD和RMSF分析评估了复合物的稳定性，并将关键活性位点氢键的持续存在程度量化为模拟帧数的百分比。MM-PBSA结合自由能计算进一步支持了这些相互作用的热力学可行性。总体而言，这些发现凸显了Monacolin X作为乳腺癌抗血管生成药物的潜力。然而，仍需进一步的体外和体内研究来验证其疗效和临床意义。
