长江上游特有鱼类圆口铜鱼与长鳍铜鱼的近端粒到端粒基因组组装

《Scientific Data》：Telomere-to-telomere gapless genome assemblies of Coreius heterodon and Coreius guichenoti

　　

摘要

Coreius heterodon 和 Coreius guichenoti 是长江上游流域的特有鲤科鱼类。C. guichenoti 被世界自然保护联盟（IUCN）列为濒危（EN）物种，并被列为中国国家二级保护野生动物，而 C. heterodon 被IUCN列为未评估（NE）物种。然而，这些物种的基因组资源仍然有限，制约了进化和保护遗传学研究。在此，我们提出了这两种物种的近端粒到端粒基因组组装。组装结果覆盖圆口铜鱼（Coreius heterodon）的1.09 Gb和长鳍铜鱼（Coreius guichenoti）的1.08 Gb，contig N50值分别为43.10 Mb和42.62 Mb，并锚定到25条染色体上。重复元件约占每个基因组的58%，并分别注释了25,876和25,778个蛋白编码基因。两个组装均表现出卓越的完整性，BUSCO得分超过98.9%，证实了其高质量和可靠性。这些基因组组装为未来研究长江流域特有鱼类的基因组进化、适应性多样化和保护基因组学提供了高分辨率资源。