胰腺腺癌中肿瘤纯度相关三基因预后特征的鉴定及其免疫微环境机制研究

《Scientific Reports》：A tumor purity-based gene signature predicts prognosis and shapes the immune microenvironment in PAAD

　　

摘要

胰腺腺癌（PAAD）以极度致死性和致密的基质为特征，该基质掩盖了肿瘤内在的生物学特性。肿瘤纯度——即肿瘤组织内恶性细胞的比例——既影响转录组信号，也影响治疗反应，然而PAAD中由纯度驱动的分子程序仍缺乏明确界定。利用TCGA bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据集GSE155698，我们通过差异表达、LASSO和多变量Cox回归鉴定了与纯度相关的基因，并构建了一个预后模型。通过Kaplan-Meier、ROC和独立预后分析评估了预测性能。使用细胞间通讯来表征肿瘤微环境内的免疫相互作用。在独立队列（n?=?110）中通过IHC和多重IHC验证了蛋白水平的表达。一个三基因特征（AMH、PHACTR1、C5AR2）将PAAD患者分层为生存率显著不同的风险组。AMH和PHACTR1与良好预后相关，而C5AR2则预测不良结局。与单细胞数据的整合显示，低风险肿瘤表现出增强的抗原提呈和更强的CD8? T细胞活化，暗示肿瘤纯度在塑造免疫监视中的作用。蛋白验证确认了临床样本中一致的表达模式。我们鉴定了一个与肿瘤纯度相关的三基因特征，该特征能稳健地预测患者生存，并揭示了一个涉及CD8? T细胞活化的免疫调节轴。这些生物标志物为肿瘤纯度如何影响PAAD进展提供了机制性见解，并可能指导个体化治疗。