保加利亚2024–2026年高致病性禽流感A(H5N1)疫情的空间-分子流行病学特征及基因型多样性分析
《Life》:Spatial Distribution and Genetic Diversity of Highly Pathogenic Avian Influenza A (H5N1) in Bulgaria, 2024–2026
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时间:2026年10月28日
来源:Life 3.4
摘要
高致病性禽流感(HPAI)A(H5N1)仍然是欧洲家禽生产和野生动物健康的重要威胁。本研究旨在描述2024–2026年期间保加利亚HPAI A(H5N1)疫情的空间、时间和遗传模式。采用空间和分子流行病学方法分析了44起已确认的疫情。使用Clark–Evans最近邻分析评估空间聚集性,同时使用核密度估计(KDE)识别疫情集中度升高的区域。应用DBSCAN聚类来表征空间聚集和地理隔离的疫情。35起疫情可获得基因型数据,并使用Fisher精确检验评估基因型与空间组以及记录宿主或家禽生产类别之间的关联。进一步利用系统发育重建对血凝素(HA)序列进行分析。疫情表现出显著的空间聚集性,最高集中度出现在保加利亚中南部,次要热点位于保加利亚东南部。DBSCAN识别出四个空间聚类和八个地理隔离的疫情。EA-2023-DA是主要基因型,占35起已分型疫情中的25起(71.4%),并显示出广泛的空间和时间分布。其他基因型,包括EA-2021-AF、EA-2024-DF、EA-2024-DI DI.2和EA-2024-DI DI.2.1,出现频率较低,且空间分布更为局限。不同DBSCAN空间组之间的基因型组成差异显著(Fisher精确检验,p = 0.0152)。然而,当作为二元基因型比较进行分析时,EA-2023-DA在最大空间聚类中的富集不具有统计学显著性。基因型与记录宿主或生产类别之间的总体关联显著(p = 0.0357),但在排除未指明家禽后不显著(p = 0.2162),或仅限于鸭和蛋鸡时也不显著(p = 0.7318)。总体而言,研究结果表明保加利亚HPAI A(H5N1)疫情呈现显著的空间异质性,同时不同空间组之间的基因型组成存在显著差异。EA-2023-DA的广泛检出,以及遗传上独特且地理分布更为局限的基因型的出现,表明多个病毒谱系同时流行。空间、时间和分子监测的整合有助于更好地识别疫情集中度升高的区域,并加强保加利亚的HPAI监测和控制策略。
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