《Microbiology Spectrum》：Seasonal changes of respiratory infections in Northern Finland 2019–2024: evaluation of different diagnostic tests in rapidly changing epidemiological environment
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在初级卫生保健中，呼吸道感染（respiratory tract infections, RTIs）是患者就医的主要原因之一。RTI诊断实验室检测既可为个体患者的治疗提供信息，也可更广泛地提供特定感染的流行病学分布信息。在SARS-CoV-2大流行期间，202
在初级卫生保健中，呼吸道感染（respiratory tract infections, RTIs）是患者就医的主要原因之一。RTI诊断实验室检测既可为个体患者的治疗提供信息，也可更广泛地提供特定感染的流行病学分布信息。在SARS-CoV-2大流行期间，2020年迅速开发了诊断性qPCR检测方法，随后该病毒特异性检测被整合到多重PCR检测中，后者还可同时检测其他常见的季节性流行病毒，包括甲型流感、乙型流感和RS病毒。研究人员在此提供了2019年至2024年间芬兰北部23种微生物的流行病学分布数据。虽然冠状病毒是最突出的检出微生物，但腺病毒、RS病毒、流感病毒、肺炎支原体（Mycoplasma pneumoniae）、肺炎衣原体（Chlamydia pneumoniae）以及百日咳鲍特菌/副百日咳鲍特菌（Bordetella pertussis/parapertussis）也是常见的检出微生物。将多重PCR纳入RTI诊断，尤其是在初级卫生保健中，将提供更多的流行病学数据；然而，实验室检测的成本效益与数据可用性之间的关系仍有待阐明。
呼吸道感染（RTIs）是造成医疗系统负担的主要原因之一。芬兰急性呼吸道症状是第三常见的就医原因。由于病原体种类繁多且症状相似，区分不同RTIs具有挑战性。一些RTI病原体如博卡病毒、副流感病毒和鼻病毒主要引起自限性、较轻的RTI，无特异性治疗且很少导致住院；而另一些病原体如流感病毒、SARS-CoV-2、嗜肺军团菌（Legionella pneumophila）和百日咳鲍特菌（Bordetella pertussis）则需要特异性治疗和快速识别。因此，为避免不必要的抗生素使用，区分病毒和细菌感染至关重要。实验室检测目前主要依赖抗原或PCR方法；多重PCR可在单一检测中同时识别多种病原体。在COVID-19大流行高峰期，大量筛查以单病原体检测为主，而流感与SARS-CoV-2的区分需求促使检测策略调整。本研究收集了2019年至2024年间芬兰北部23种呼吸道病原体的流行病学数据，比较不同年龄组、年份及五种不同诊断检测方法的阳性率差异，旨在评估不同分析方法的性能，并观察在COVID-19大流行迅速改变全球及本地RTI流行病学背景下的结果变化。研究结论显示，SARS-CoV-2成为最突出的检出病原体，但腺病毒、RS病毒、流感病毒、肺炎支原体、肺炎衣原体和百日咳鲍特菌等也常见；儿童（0–4岁）在广泛多重PCR检测中阳性率较高，而成人及老年人阳性率较低；2024年观察到肺炎支原体、腺病毒和百日咳鲍特菌阳性率上升。将多重PCR纳入RTI诊断可提供更多流行病学数据，但其成本效益仍需明确。重要临床意义在于，多重PCR有助于识别需要靶向治疗或隔离的病原体，监测流行病趋势，并可能优化抗微生物药物管理。
关键方法方面，样本来自芬兰奥卢Nordlab临床微生物学实验室2019—2024年间根据临床医生申请接收的共计727,610份呼吸道样本，主要为鼻咽拭子。检测方法包括五种核酸检测面板：InABRSV（GeneXpert Xpress Flu/RSV）、RVirNhO（Seegene Allplex panels）、CV19NhO（多种SARS-CoV-2检测）、InRSCoV（Xpert Xpress SARS-CoV2/Flu/RSV及NeuMoDx）和RespNhO（QIAstat DiagCORE Respiratory Panel 2）。统计分析采用R软件（4.3.0），对每种检测类型分别拟合负二项回归模型，以阳性例数为因变量，年龄组、月份和年份为分类自变量，检测总数作为偏移量，计算发病率比（IRR）及95%置信区间（CI）。
**Overall epidemiological findings in Northern Finland 2019–2024**。研究人员通过分析各年份检出病原体数量发现，在COVID-19大流行前（2019年），芬兰北部最常见的实验室确诊RTI病原体为甲型流感、鼻病毒/肠道病毒组（所用检测不能区分鼻病毒和肠道病毒）、RS病毒、腺病毒、副流感病毒和非SARS-CoV-2冠状病毒。2020年SARS-CoV-2成为最常见病原体，其余病原体检出数量大幅下降，其中鼻病毒/肠道病毒下降幅度较小；RSV下降出现在2021年。2021—2022年SARS-CoV-2明显占主导，2023年开始下降。2024年观察到肺炎支原体（Mycoplasma pneumoniae）、腺病毒和百日咳鲍特菌（Bordetella pertussis）的检测阳性率上升，而此前常见的流感A、鼻病毒/肠道病毒和RS病毒也重新出现。
**Age-related test positivity for RTI**。通过按年龄组（0–4岁、5–14岁、15–64岁、≥65岁）分层分析，以5–14岁为参考组，研究人员发现0–4岁儿童在InRSCoV（IRR: 1.33; 95% CI: 0.90–1.96）、RespNhO和RVirNhO（IRR均为1.56; 95% CI: 1.38–1.76）中表现出升高的发病率比，而CV19NhO（IRR: 0.83）和InABRSV（IRR: 0.86）无显著差异。15–64岁和≥65岁人群在所有测试类型中的IRR均显著降低，其中InABRSV最低（IRR分别为0.34和0.23）。这表明儿童是RTI病原体检测阳性的高风险人群，而成人和老年人较低的阳性率可能反映其因基础疾病或症状非典型而有更低的检测阈值。
**Year- and diagnostic test-specific positivity for RTI**。以2019年为参考年份，整体RTI阳性率在2020年（IRR: 0.62）和2021年（IRR: 0.57）下降，2022年显著上升（IRR: 1.83），2023年和2024年仍维持较高但未达显著水平。按检测方法分析：InRSCoV在2022年显著升高（IRR: 2.27），2023年达峰（IRR: 2.46），2024年回落（IRR: 1.83）；CV19NhO以2020年为参考，2021年急剧升高（IRR: 6.50），2022年进一步升高（IRR: 66.84），2023年仍高（IRR: 40.13），2024年因该检测停止使用而无法估计；RespNhO和RVirNhO在2020—2021年较低，2022年上升（IRR: 1.15），2024年显著升高（IRR: 1.33）；InABRSV各年变化无显著差异。这些结果说明不同检测方法对流行病学变化的敏感度不同，宽面板检测有助于发现单一检测可能遗漏的病原体流行。
讨论部分指出，COVID-19大流行期间多数RTI病原体阳性率大幅下降，其中鼻病毒/肠道病毒减少最少。2024年出现的肺炎支原体和百日咳鲍特菌流行，若没有多重PCR检测可能被漏诊。不同年龄组的阳性率差异可能源于免疫交叉保护、重复暴露以及检测实践差异。多重PCR在儿童RTI中的作用证据尚不一致，但可缩短住院时间、增加流感抗病毒治疗使用等。宽面板（RespNhO）成本约为窄面板（InRSCoV）的1.7倍，但其对特殊患者人群和流行病学监测具有价值。研究优势在于大样本量，局限性为回顾性设计且无法获取患者结局。研究结论可翻译为：本研究旨在回顾性评估不同分析方法的性能，并观察在COVID-19大流行迅速改变全球及本地区RTI流行病学背景下检测结果的变化；诊断检测方法的改变主要基于本地资源情况。
