TP53（Arg72Pro）和NBN（Glu185Gln）功能性变异与南印度女性卵巢癌的关联：病例对照及计算机模拟分析

《Gene Reports》：Association of TP53 (Arg72Pro) and NBN (Glu185Gln) functional variants with ovarian cancer in South Indian Women: A case–control and in silico analysis

　　DNA修复通路与卵巢癌风险相关 首个将TP53第72密码子变异与南印度女性卵巢癌风险联系的研究 TP53变异增加研究人群的卵巢癌易感性 NBN变异在卵巢癌发生中作用有限 章节摘要 缩写 AGE：琼脂糖凝胶电泳 AIC：赤池信息量准则 aOR：校正比值比 ATM：共济失调性毛细血管扩张症突变蛋白 ATR：共济失调性毛细血管扩张症与Rad3相关蛋白 ATRIP：ATR相互作用蛋白 BMI：体质指数 CHEK1：检查点激酶1 CI：置信区间 DDR：DNA损伤反应 DSB：双链断裂 FIGO：国际妇产科联盟 HWE：哈迪-温伯格平衡 MAF：最小等位基因频率 MDM2：小鼠双微体2同源物 MRE11：MRE11同源双链断裂修复核酸酶 MRN：MRE11-RAD50-NBS1复合物 参与者招募与样本收集 本研究为基于医院的病例对照研究，共纳入494名女性，包括240例经组织学确诊的卵巢癌患者和254例无癌对照。卵巢癌病例于2023年至2025年期间从Dr. GVN癌症研究所和Meenakshi Mission医院与研究中心的肿瘤门诊招募。对照组由地理匹配、年龄相当（±3岁）、无癌症病史记录的健康女性组成。研究队列的人口统计学与临床特征 本研究共纳入494名女性，包括240例经组织病理学确诊的卵巢癌患者和254例年龄匹配的健康对照。卵巢癌组的平均年龄为55.08±11.29岁（范围：17–79岁），而对照组的平均年龄为53.07±14.89岁（范围：20–88岁）。研究人群的临床病理特征总结于表1。哈迪-温伯格平衡与统计功效评估 对照组中TP53和NBN多态性的等位基因与基因型频率为（此处内容不完整，原文被截断）讨论 卵巢癌是一种异质性恶性肿瘤，其中DNA损伤反应与修复基因的遗传变异可能通过受损的基因组维护导致易感性改变。在本病例对照研究中，我们首次研究了两个关键的DNA修复相关基因TP53（rs1042522）和NBN（rs1805794），以评估它们与卵巢癌风险、临床病理特征以及潜在功能后果的关联，并采用体外模拟方法进行分析。 TP53 rs1042522（Arg72Pro）（此部分文本被截断）结论 综上所述，本研究提示TP53 rs1042522（Arg72Pro）多态性可能显著增加南印度女性对卵巢癌的易感性，而NBN rs1805794（Glu185Gln）变异在疾病易感性中作用有限，但可能影响肿瘤进展。体外模拟分析表明，NBN Glu185Gln在很大程度上被预测为良性功能效应，而蛋白质稳定性预测结果不一致，多种算法提示（此处内容不完整）CRediT作者贡献声明 Harshavardhani Canchi Sistla：写作-审阅与编辑、写作-初稿、项目管理、方法学、调查、正式分析、数据管理、概念化。 Arun Seshachalam：资源、方法学、监督。 Krishna Kumar Rathnam：资源、方法学。 Taruna Rajagopal：写作-审阅与编辑。 Srikanth Talluri：写作-审阅与编辑。 Nageswara Rao Dunna：写作-审阅与编辑、写作-初稿、验证、监督、资源、项目（此处内容不完整）参与同意 所有研究参与者均获得书面知情同意。伦理批准 本研究经Dr. GVN癌症研究所机构伦理委员会（GVNCI–IEC–ECR/436/INST/TN/2013，日期2023年5月18日）和MMRCH（MMRCH-IEC-ECR/398/INST/TN/2013/RR-19，日期2023年12月4日）批准。写作过程中使用生成式AI与AI辅助技术的声明 在撰写本工作期间，作者使用了AI驱动的写作辅助工具Grammarly来编辑和校对稿件。使用该工具后，作者根据需要审查并编辑了内容，并对出版物的内容承担全部责任。资助 本研究由SASTRA-TRR研究计划（SASTRA-TRR-SCBT-1-11092024）资助。利益冲突声明 作者声明无利益冲突。致谢 作者衷心感谢所有自愿参与本研究的参与者，以及Dr. G.V.N.癌症研究所和MMHRC的医务人员提供的宝贵支持。我们还要向SASTRA视为大学深表谢意，感谢其提供资金支持和基础设施。作者：Harshavardhani Canchi Sistla、Arun Seshachalam、Krishna Kumar Rathnam、Taruna Rajagopal、Srikanth Talluri、Nageswara Rao Dunna