《Genetics in Medicine》:Domain-associated phenotypic patterns with
MACF1 variants
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摘要目的虽然微管肌动蛋白交联因子1(MACF1)微管结合GAR结构域中的杂合新发错义变异会导致伴复杂脑干畸形的无脑回畸形9型(LIS9)[MIM 618325],但该结构域之外变异的表型影响仍不清楚。方法我们汇集了一个由来自4个不相关家系的5名受累个体组成的队列,这些个体携带双等
摘要
目的
虽然微管肌动蛋白交联因子1(MACF1)微管结合GAR结构域中的杂合新发错义变异会导致伴复杂脑干畸形的无脑回畸形9型(LIS9)[MIM 618325],但该结构域之外变异的表型影响仍不清楚。
方法
我们汇集了一个由来自4个不相关家系的5名受累个体组成的队列,这些个体携带双等位基因非GAR结构域MACF1变异,表现出部分重叠但独特的表型特征。另外还发现了一名携带新发杂合移码变异的个体。结合既往报告的病例,我们使用基于人类表型本体论(HPO)的无监督层次聚类分析了22名个体的基因型和表型数据。
结果
聚类分析揭示了两种截然不同的表型特征,提示存在结构域相关的效应。GAR结构域之外的变异与更广泛的神经发育表型以及颅面和骨骼受累相关。使用OMIM HPO集的富集分析(p < 0.001)支持这些发现。与GAR结构域与LIS9的强相关性相反,双等位基因非GAR结构域MACF1变异与不同的发育异常相关。
结论
这些结果扩大了MACF1相关疾病的表型谱,并为MACF1变异的结构域相关效应提供了初步证据。尽管受样本量和缺乏功能验证的限制,这些发现应被视为产生假设的,并强调了随着更多病例的出现,基于HPO的聚类方法在系统性表型比较中的实用性。全面的遗传和表型评估对于理解MACF1在发育中的作用、指导诊断以及未来研究细胞骨架调控在神经发育中的机制至关重要。
Nikhita Gogate|Angad Jolly|Jill A. Rosenfeld|Paulina Bahena-Carbajal|Diana Carrasco|Jonathan A. Bernstein|Devon E. Bonner|Tiffany Busa|Ingrid Cristian|Precilla D’Souza|Jennifer Friedman|Svetlana Gorokhova|Thomas Haaf|Isabella Herman|Ugur Ufuk Isin|Shalini N. Jhangiani|Ivy Johnson|Jerica Lenberg|Ellen F. Macnamara|Reza Maroofian|Jennifer E. Posey
美国德克萨斯州休斯顿贝勒医学院分子与人类遗传学系,邮编77030