良恶性胆道梗阻患者胆道微生物群落的结构与拓扑特征研究

《Gut Pathogens》：The biliary microbiome in obstructive disease: a shotgun metagenomic comparison of benign and malignant conditions

　　背景：研究胆道微生物群的贡献对于理解肝胆疾病进展至关重要，其中持续性炎症可能促进肿瘤发生。微生物群是胆汁酸代谢的关键介质，其组成和结构的改变可能促使严重临床疾病的发生和进展。基于这一前提，作者旨在表征48例肿瘤患者中患有良性（n=24）或恶性（n=24）胆道梗阻（分别为BBO和MBO）的胆道微生物群落。通过内镜逆行胰胆管造影术采集胆汁样本，并进行全基因组鸟枪法测序以表征微生物群落。结果：BBO与MBO在Simpson指数、丰富度和Shannon多样性指数方面无显著差异。总体而言，两个人群之间观察到34个共有的微生物属，而若干属仅存在于BBO或MBO中。主成分分析显示两组均存在四个微生物簇。特别地，包含志贺菌属、耶尔森菌属、肠杆菌属、光杆菌属、埃希菌属、克雷伯菌属、弧菌属和异杆菌属的拓扑簇在BBO的微生物网络中被发现。相反，MBO网络的拓扑结构表现出更高的连通性群落。结论：对胆道微生物群落及其结构的表征可能增进我们对其在肝胆疾病中作用的理解。此外，微生物群落拓扑特征的识别可能为宿主-微生物群相互作用提供新的见解。