人工智能(AI)革命对社会的许多方面产生了根本性影响,深刻影响了生物技术产业,并且已经在重塑研究机构开展创新的方式。在CRISPR、合成生物学和基因组学的交汇处,基因组编辑领域因AI革命而得到增强,各种工具和试剂正被大规模开发并应用于各实验室和研究机构。
基因组编辑的许多方面都受到了AI的影响,从扩展分子工具箱到将其部署到生命之树中。例如,许多关注点集中在通过挖掘宏基因组数据集的暗物质来建立多样化的Cas效应蛋白(Cas9、Cas12、Cas13、CAST和Cascade-Cas3),寻找新颖且古老的效应蛋白(TnpB、IscB、TIGR-Tas,以及最近的病毒干扰可编程重复序列,即VIPR)。同样,AlphaFold的结构洞察推动了越来越具特异性、高效和精准的基因组编辑效应蛋白的创造。像Evo2这样的模型现在提供了如何最好地利用遗传密码的独特性,甚至通过基因组语言模型在计算机中生成新型生物实体的见解,这些模型在天然细菌中产生具有体内活性的合成噬菌体。
现在,我们正目睹激动人心的下一代基因组编辑工具从学术界向工业界转型,正如Peter Yoon(曾在Jennifer Doudna的创新基因组学研究所实验室工作)和Matt Durrant(曾在Patrick Hsu的Arc研究所实验室工作)所展示的,他们现在正在Anthropic推动颠覆性创新,分别从VIPR和大型丝氨酸重组酶(LSRs)转向宏基因组的智能代理挖掘。当前一代博士生必须满足AI技能要求并展示AI能力,不仅通过边缘的副业项目,而且在某些情况下作为其研究生经历的主要焦点。
回顾过去50年,AI能力已经在取代分子生物学在1980年代的地位、基因组学在1990年代的地位、生物信息学在2000年代的地位以及CRISPR在2010年代的地位。在医学、生物技术、食品和农业领域,AI工具、代理和平台正在实时、大规模地推动工业界、学术界和政府机构的研究群体,加速基因组编辑的开发和部署,为社会、消费者和患者带来许多相关利益。
AI狂热
然而,尽管AI对基因组编辑工具箱的贡献具有不可否认的科学价值,但AI投资狂潮对CRISPR公司的融资产生了负面影响。令人费解的是,估计80%至85%的风险投资资金正疯狂地投入AI相关领域。现在,所有投资者都必须考虑在AI领域下注,因为其上行潜力、高得离谱的估值、快速的退出和惊人的倍数。当前投资者对AI的狂潮与最初的“CRISPR热潮”不在一个量级上。这意味着所有其他领域都在竞争投资池的一小部分,这已经对CRISPR产业生态系统在各个发展阶段产生了负面影响。
寻求平台建设和临床前资产开发融资的早期初创公司资金已经枯竭。拥有有前景临床试验数据的公开上市公司难以筹集关键的III期试验资金,甚至难以生存(参见Caribou Biosciences最近的公告)。在某些情况下,尽管有令人信服的患者数据展示了纠正遗传疾病的持久基因疗法和拯救生命的恶性肿瘤细胞疗法,但令人费解的是,建设数据中心比治愈患者更有吸引力。基因组编辑领域很难与AI时间表、估值和倍数的无理期望和基准竞争,这些正在分散生物技术和制药投资者的注意力。
尽管投资委员会负有可理解的信义义务,风险投资以营利为使命,但投资者应对我们的利益相关者负责,并有勇气继续投资于改变生活和有利可图的事业。在最大化股东利润和优化利益相关者利益之间可能存在细微的界限。在《CRISPR杂志》,我们仍然希望我们能保持对基因组编辑的集体承诺,以造福人类和世界。希望这些暂时的挑战不会阻碍在CRISPR生态系统中必要的人力和财力投入。